Персидские фланги, а вслед за ними и центр устремились к берегу, где стояли корабли. По-видимому, Датис организовал некое подобие арьергарда для прикрытия панической посадки своего разгромленного войска. Только таким образом можно объяснить, как он ухитрился уйти с большей частью флота, причем с относительно малыми потерями личного состава и кораблей. Во время последнего этапа сражения, уже у самой воды, греки потеряли 192 убитых, среди которых оказался и Каллимах. Считается, что персы потеряли 6400 человек.

Мильтиад тут же повел своих уставших, но торжествующих воинов назад в Афины. В надежде, что известие о победе укрепит дух афинян и они продержатся до прихода армии, он отправил вперед скорохода Федипеда, первым в истории пробежавшего марафонскую дистанцию —42 км. Когда афинская армия вошла в город, персидский флот только приближался к берегу. Поняв, что опоздал, Артаферн повернул флот назад.

Вечером в город пришли спартанцы – но их помощь уже не потребовалась.

490. Планы мести Дария. Разъяренный Дарий замышляет окончательно подчинить Грецию и готовится к новому сухопутно-морскому походу.

486–484. Восстание в Египте. На время персы вынуждены отвлечь часть сил на подавление восстания. В этом они преуспевают, но в 486 г. Дарий умирает.

484–481. Ксеркс возобновляет подготовку к походу. За три года Ксеркс собирает в Сардах невиданную по тем временам 200-тысячную армию. Наводит два длинных понтонных моста через Геллеспонт (современные Дарданеллы), чтобы армия могла двигаться двумя параллельными колоннами. Опасаясь, что эллинам помогут богатые греческие колонии Сицилии, Ксеркс заключает договор с Карфагеном. Последний обещал, что нападет на Сицилию, как только персы вторгнутся в Грецию. Подготовка персов к походу свидетельствует об их недюжинном дипломатическом таланте, а также удивительной способности к стратегическому и хозяйственному планированию. Несмотря на победу при Марафоне, военная мощь персов по-прежнему внушает страх эллинам, и они не на шутку встревожены известиями о подготовке Ксеркса к походу на Грецию. Большинство афинян и подавляющая часть пелопоннесских государств во главе со Спартой решают противостоять персам. Остальные, убежденные в непобедимой военной мощи персов, стремятся сохранить нейтралитет или открыто поддерживают Ксеркса.

484–483. Афинские дебаты по военной политике. Затяжная война с Эгиной, постоянной соперницей Афин, заставляет часть граждан, во главе с Фемистоклом, ратовать за усиление флота – тем более что противостоять персам на суше не представляется возможным. Остальные граждане, во главе с Аристидом, исходя из уязвимости Афин для сухопутного вторжения, стоят на том, что никакой, даже самый большой в мире флот не сможет защитить город от персов. Вопрос выносят на голосование в народное собрание: Аристид проигрывает, и в 483 г. Фемистокл приступает к строительству боевого флота триер.

481–480. Дебаты по стратегии между Спартой и Афинами. На этот раз два города не сходятся во мнении, как отразить вторжение персов. Пелопоннесцы предлагают оставить всю часть Греции, лежащую к северу от Коринфского перешейка, полагая, что этот семикилометровый коридор идеально подходит в качестве оборонительного рубежа. Однако афиняне покидать свой город отказываются. Фемистокл указывает на уязвимость Пелопоннеса для нападения персов с моря и утверждает, что их наступление можно с успехом остановить на суше и на море, но значительно севернее. Понимая значимость афинского флота, спартиаты неохотно соглашаются со стратегией Фемистокла.