В 1937 году Билла отозвали в Москву, а ему на смену прислали другого офицера ГРУ – полковника Бориса Быкова, который одобрительно отнесся к шпионским планам Петерса. Однако им не суждено было сбыться. В апреле 1938 года Уиттейкер Чэмберс, один из подопечных агентов Быкова, сбежал вместе со своей семьей во Флориду и через посредников дал понять своим бывшим сообщникам, что, если против него будут предприняты какие-либо злонамеренные шаги, он предаст гласности компрометирующие их материалы, имевшиеся в его распоряжении.

Дезертирство Чэмберса заставило изрядно поволноваться и агентов советской разведки, и американских подпольщиков-коммунистов. Над ними нависла прямая угроза разоблачения. Вся полнота ответственности за провал была возложена на Петерса. В результате в июне 1938 года Петерса сменил на посту главы секретного аппарата КПА Руди Бейкер. А после того как в 1948 году история Чэмберса была обнародована в американской прессе, Петерс был вызван повесткой на заседание сенатского комитета, занимавшегося расследованием этого дела. Он отказался отвечать на любые вопросы и был депортирован в Венгрию.

Бейкер пребывал на посту руководителя секретного аппарата КПА вплоть до конца Второй мировой войны. В отличие от его предшественника Бейкера ни разу не вызывали для дачи показаний ни в какие сенатские комитеты. Средства массовой информации обошли его персону своим вниманием. Не был он и насильно выдворен за пределы США. В конце 40-х годов Бейкер незаметно покинул страну и через некоторое время объявился в Югославии, где стал работать переводчиком в одном из местных издательств.

Анонимность Бейкера была хорошо спланированной акцией. Еще в 1939 году в своем отчете, отправленном в Москву, он отметил весьма существенный, по его мнению, недостаток в работе секретного партийного аппарата: «Проблема состоит в том, что стало слишком широко известно, что этой работой руководит Петерс».

Тогда же Бейкер отметил, что, выбрав его в качестве нового руководителя секретного аппарата, Браудер «прежде всего беспокоился о том, чтобы передать ему руководство этой работой таким образом, чтобы его участие в ней не стало столь же широко известно, как в случае с Петерсом».

Чтобы скрыть истинный характер его партийной работы, Браудер давал Бейкеру другие поручения, служившие прикрытием.

Как и Петерс, Бейкер был эмигрантом из Восточной Европы. Он родился в Хорватии в 1898 году. Его настоящие имя и фамилия – Рудольф Блюм. В 1909 году вместе с родителями Бейкер переехал жить в США. В 1919 году он вступил в КПА, и с 1927 по 1930 год проходил стажировку в Москве. По возвращении из Советской России Бейкер выполнял ряд партийных поручений по налаживанию подпольной работы в Канаде и Англии. Детальные сведения о том, как был устроен секретный аппарат КПА при Бейкере, отсутствуют. Однако из рассекреченных архивов ФБР и дешифровок «Веноны» в общих чертах известна структура этого аппарата, равно как имеются данные о некоторых его сотрудниках и методах работы.

В январе 1939 года Бейкер посетил Москву, где провел серию встреч с руководством Коминтерна, на которых обсуждались основные направления его деятельности на новом посту. Поддержание шифрованной связи с Москвой стало одной из основных обязанностей Бейкера. После возвращения из Москвы он активно занялся решением этой проблемы. В результате к радиопередатчикам, которые в 1930-е годы активно использовались для обмена сообщениями с руководством Коминтерна, добавились другие виды связи. В 1930-е годы в США отсутствовала отлаженная система тотальной слежки за международными почтовыми отправлениями. Власти редко обращали на них свое внимание. Исключение составляла почта, отправитель или получатель которой подозревались властями в противозаконной деятельности. Рядовые американские коммунисты могли, не вызывая ни у кого подозрений, получать любую почтовую корреспонденцию из Москвы. Все изменилось с началом Второй мировой войны. Поэтому в 1940 году Бейкер сообщил в Москву о том, что вынужден перейти на использование микроточек