Криминалисты все выходные исследовали место преступления, разыскивая отпечатки пальцев и собирая предметы, с которых можно было взять образцы ДНК. В пятне крови рядом с трупом Мередит был обнаружен отпечаток пальца; с помощью препарата «Луминол» (который реагирует на кровь) были найдены следы крови в других местах. Утверждалось, что найдены отпечатки пальцев на двух мобильных телефонах Мередит. Следователи также внимательно изучали список последних звонков.

Кьяккьера с коллегами также не обошли вниманием фотографии с Хеллоуина и другие фотографии с Facebook, на которых были запечатлены знакомые девушки. Некоторые снимки были сделаны в ресторанчиках Перуджи, включая бар «Мерлин», совладельцем которого был Паскуале Алесси и в котором Мередит часто бывала. Несколько фотографий было сделано на вечеринке в честь Хеллоуина в «Мерлине». Алесси помог полицейским установить личность снятых на них людей, включая студента-американца, который подрабатывал там вышибалой, и ливийского студента, изучавшего информатику. Ряд фотографий сделал тридцатитрехлетний Дженнаро Крульяно, который также помог полиции установить личность сфотографированных.

К тому времени в Перудже все только и обсуждали подробности убийства, строя различные предположения по поводу его мотива и личности преступника. Ходили слухи, что Мередит убил мужчина, с которым она познакомилась на одной из вечеринок во время Хеллоуина.

«Она была не из тех, кто приглашает к себе малознакомых людей», – заявил Крульяно, пытаясь пресечь подобные слухи.

«Я была с Мередит в баре тем вечером и не видела, чтобы она с кем-то знакомилась. Насколько я знаю, Мередит не получала никаких угроз», – сказала еще одна ее подруга и однокурсница, двадцатилетняя Саманта Роденхерст.

Другие также поспешили опровергнуть слухи, но без особого успеха. Для Перуджи это было из ряда вон выходящее происшествие, прогремевшее на всю Италию и даже отчасти затмившее дело «Флорентийского монстра» (несколько нераскрытых убийств, совершенных с 1968 по 1985 год). Слухи о таком преступлении вряд ли можно легко остановить.

В воскресенье, 4 ноября, в тот день, на который было назначено вскрытие, случилось необычное и мрачное происшествие. У входа в Университет для иностранцев кто-то повесил на доску объявление о том, что приглашается английская студентка для проживания в том доме, где жила Мередит, а ниже был указан вымышленный номер телефона, состоявший из тех же цифр, что и дата ее убийства. Полицейские поспешили удалить это объявление, но не смогли найти его автора.

Вечером патологоанатом Лука Лалли произвел вскрытие трупа Мередит. Позже он утверждал, что были обнаружены свидетельства «вероятной» сексуальной связи до момента смерти, но что девушка «не была изнасилована». Его сообщение помогло пресечь слухи об изнасиловании, которые уже начали попадать на страницы итальянских газет. Лалли также сказал, что, вероятнее всего, орудием убийства был перочинный нож.

После вскрытия итальянская пресса сообщила о том, что сонная артерия Мередит не была перерезана, а это означает, что смерть ее, по всей видимости, была довольно долгой и мучительной – она задыхалась и захлебывалась собственной кровью. Из заявлений патологоанатома и в результате утечки информации стало известно, что девушку душили и на ее обнаженном теле обнаружено 47 порезов и синяков. Говорили также, что полиция не исключает, что Мередит защищалась от сексуального насилия и окно было разбито намеренно, чтобы запутать следы. Таинственности происшествию придавало и сообщение о том, что 2 ноября Аманду Нокс видели в прачечной на виа Фабретти с чернокожим мужчиной из Северной Африки. Там она стирала одежду, и многие стали задумываться над тем, что это может означать.