В изданиях второй половины XIX в., посвященных истории Руссика, отмечалось: «Монастырь Богоявленский с давнего времени был в близких отношениях с Афонским Пантелеймоновым монастырем; прибывавшие из последнего за сбором доброхотных подаяний иноки всегда находили в монастыре Богоявленском покойный и радушный прием, и святыня Афонская, в сопровождении иеромонаха Арсения посещавшая Москву в 1867 г., помещена была, по распоряжению духовного начальства, в этом же монастыре». Московская обитель уступила для часовни место при входных Святых вратах, в нише, под алтарем церкви во имя св. Иоанна Крестителя (современный адрес: Никольская ул., д. 6)[123].
Освящение часовни во имя св. вмч. Пантелеймона совершил 11 февраля 1873 г. настоятель Богоявленского монастыря викарный епископ Дмитровский Леонид (Краснопевцов). «Ради чудотворений» св. вмч. Пантелеймона в монастыре была устроена не только часовня Руссика, но и Пантелеимоновский придел в Богоявленском соборе (в 1873 г.), а также ежегодно 27 июля совершались литургия и крестный ход в честь праздника святого.
Незадолго до перенесения часовни Свято-Пантелеимоновского монастыря в новое здание на Никольской улице Московская Духовная консистория 19 сентября 1879 г. обратилась в Богоявленскую обитель по вопросу устройства в освобождающемся помещении часовни афонского Евфигменского монастыря во имя св. Марии Магдалины, но получила отказ. 1 октября того же года казначей обители иеромонах Филарет написал в консисторию, что настоятель монастыря епископ Дмитровский Амвросий и старшая братия на совещании решили, что устройство новой часовни невозможно и освобождающееся помещение следует использовать под жилье. Часовня же Руссика была устроена как исключение, в связи с многочисленными чудотворениями привезенных с Афона святынь и особо близкими отношениями двух монастырей[124].
Когда в 1893 г. в благодарность за значительный вклад в дело постройки храма преп. Сергия Радонежского на Ходынском поле заведующий Московским подворьем Руссика преп. иеромонах Аристоклий был награжден украшенным драгоценными камнями наперсным крестом, управляющий Московской епархией епископ Александр возложил его на иеромонаха 27 июля, в праздник св. вмч. Пантелеймона именно в Богоявленском монастыре[125]. Тесные связи этой обители с Московским подворьем Руссика продолжались вплоть до ее ликвидации в 1919 г.
Подобные же связи Свято-Пантелеимоновский монастырь во второй половине XIX в. имел с Тихвинской девичьей пустынью в слободе Борисовка Курской губернии, настоятельницей которой была родная сестра духовника Руссика иеросхимонаха Иеронима (Соломенцева) игумения Маргарита (Соломенцева), а казначеем – племянница о. Иеронима монахиня Лидия (Соломенцева). В 1861 г. Тихвинской Борисовской пустыни по просьбе о. Иеронима изготовили для Руссика две плащаницы, шитые золотом по бархату (каждая ценой 100 рублей серебром), а в 1874 г. – еще одну В 1882 г. насельник Свято-Пантелеимоновского монастыря иеромонах Илиодор определил в пустынь свою престарелую мать с ежегодным содержанием 150 рублей от Руссика[126].
В 1880-е гг. иеросхимонах Иероним ежегодно посылал в Тихвинскую пустынь ее насельницам по 10-20 рублей к праздникам св. вмч. Пантелеймона и Покрова Божией Матери. Также в монастырь высылалась милостыня на трапезу «бедным старушкам», тысячи «Афонских листков», рыба и икра для раздачи бедным, часы, утварь, а также святыни. В частности, 23 января 1880 г. игумения Маргарита писала старцам Руссика архимандриту Макарию и отцу Иерониму: «Со всеми сестрами вверенной мне обители приношу вам наичувствительную благодарность за присланную вами драгоценную святыню частицы мощей и свидетельство в достоверности их; все это я получила в сохранности. Мы верим, что заступничеством и молитвами этих святых угодников и угодниц Божиих обитель наша будет всегда охраняема от всяких напастей. Как я, так и племянница моя, мать Лидия, старицы и все сестры нашей обители свидетельствуем вам глубочайшее почтение и просим вашего отеческого благословения и святых молитв о нас, грешных»