В том же 1459 г., еще до рождения Джема, по повелению Фатиха было начато сооружение огромной мечети, для чего были предварительно снесены остатки церкви Св. Апостолов. Строительство «кюллийе», то есть религиозного комплекса, получившего название Фатих Джами, или мечеть Завоевателя, продолжалось более десяти лет. Помимо самой мечети, самой большой в Османской империи в то время, в комплекс входили во семь медресе, а также школа лекарей, лазарет, приют для умалишенных, начальная школа, караван-сарай, общественная баня и усыпальница с двумя мавзолеями, одним для Фатиха, а другим для его жены Гюльбахар, матери престолонаследника Баязида. Примеру султана последовал Махмуд-паша, который позже построил большую мечеть. При ней были общественная баня, рынок и мавзолей.

Развалины древней Трои

В 1459 г. Фатих начал также строительство своей новой резиденции – дворца, который станет известным как Топкапы. Несмотря на то что в предыдущем году было завершено сооружение султанского дворца, Мехмед II, похоже, испытывал нужду в более уединенном месте обитания и административном центре, которые он и создал на мысе между Золотым Рогом и Мраморным морем. В высшей точке древнего акрополя определили места для павильонов и внутренних двориков дворца, а чуть ниже разбили фруктовые сады и цветники. Пока шло строительство Топкапы, Фатих со своим двором продолжал обитать в первоначальной резиденции, которую со временем стали называть Эски Сарай, или Старый дворец.

В том же году султан приказал приступить к сооружению еще одного религиозного комплекса, место для которого выбрани за пределами города, на дальних подступах к бухте Золотой Рог и назвали в честь Эйюба Ансари, соратника и знаменосца пророка Мухаммеда.

Ходили слухи, что много лет спустя после смерти пророка Эйюб был одним из предводителей арабского войска, осаждавшего Константинополь в 674–678 гг. н. э. Во время этой осады он погиб и был похоронен у стен византийской столицы. В 1453 г. Мехмед II организовал поиски метлы Эйюба. Свершилось чудо, и она была обнаружена шейх-уль-исламом Акшемсеттином, после чего султан повелел произвести перезахоронение останков Эйюба в изысканно украшенном мавзолее (тюрбе). Этот мавзолей, как часть нового религиозного комплекса Эйюб Джами, был перестроен в 1459 г. и стал самой почитаемой исламской святыней в Турции. Позднее установилась традиция, согласно которой интронизация султанов, главным моментом которой было опоясывание мечом Османа Гази, происходила именно там.

Мечеть Фатих Джами или мечеть Завоевателя

Ранней весть и 1460 г. Мехмед II двинул свои войска на остров Пелопоннес, где правили Фома и Дмитрий Палеологи, братья покойного императора Константина. Дмитрий сдался Фатиху в своей столице Мистре 29 мая 1460 г., ровно через семь лет после паления Константинополя. Фома бежал в Италию. Султан забрал Дмитрия с собой в Эдирне и впоследствии позволил ему поселиться в городе Дидимолике, где он и скончался в 1470 г. Единственный уцелевший осколок Византии исчез с политической карты в августе 1461 г., когда Фатих захватил Трапезунд (Трабзон). Последнего императора Трапезунда, Давида Комнина, отвезли в Эдирне, где и держали в заточении вместе с семьей. Затем 1 ноября 1463 г. Мехмед II приказал казнить Давида и двух его старших сыновей. Однако младшего сына императора, Георгия, и его дочь Анну он пощадил. Георгия отдали в турецкую семью, где из него вырастили мусульманина. Дальнейший след этого последнего потомка императорской династии Комнинов в истории теряется. Анну также обратили в ислам и выдали замуж сначала за одного, а потом за другого турецкого пашу. После смерти второго мужа она попала в гарем султана, где и окончила свои дни.