Оппозиционная российской власти «Новая газета» в свое время также достаточно подробно писала о «странных долговых решениях Касьянова»: «В качестве первого вице-премьера и министра финансов он подписал от имени Минфина договор № 01-01-06/26-311 об уступке требования, а попросту говоря, о передаче права требований по долгу МПС перед Минфином безвестной офшорной кипрской компании «Фелирио Трейдинг компани лимитед» (Felirio Trading Co. Limited): «Если перевести марки, от которых отказался в пользу киприотов Касьянов, в доллары, получится 38,4 миллиона. Чувствуете разницу? Мы им почти 39 млн долл., а они нам за это бумаг на 26 млн долл. 13 млн долл. разницы кому?».
Не меньшее количество публикаций связывает М. Касьянова с «пропажей» стабилизационного кредита МВФ в 1998 году.
Например, в 2005 году «Комсомольская правда» опубликовала журналистское расследование по распределению в дни августовского кризиса Михаилом Касьяновым стабилизационного кредита МВФ «между несколькими олигархическими банками, которые вскоре обанкротились»: «В 1998 году Россия получила очередной кредит в размере 4 миллиардов 800 миллионов долларов на стабилизацию курса рубля от МВФ: суть в том, что банки, получив 4 миллиарда долларов, вместо живых рублей вручили любимому государству гособлигации ГКО и ОФЗ, которые к тому времени превратились в никчемные бумажки и могли использоваться только в качестве обоев. И тут же все крупные банки, провернувшие аферу с кредитом МВФ, начали моментально банкротиться, переводя капиталы в свои более мелкие структуры: сначала Инком, потом СБС-Агро».
Другим громким коррупционным скандалом, связанным с именем Касьянова, стало дело «Мабетекс». Вот как описывала факты газета «Сегодня»: «Уголовное разбирательство в отношении дел «Мабетекс» и «Мерката Трейдинг стало самым громким коррупционным скандалом последних лет не только в России, но и, пожалуй, во всей Европе: в уголовном деле по «Мабетексу», которое вела швейцарская прокуратура кантона Женева, имеются еще три таких же разрешения на оплату по 20 миллионов долларов каждое. И к каждому из них самое прямое отношение имел Касьянов, а на многих документах, подшитых в том же уголовном деле, присутствует росчерк Касьянова».
В СМИ описан целый ряд других «сомнительной финансовой прозрачности решений в пользу конкретных лиц», принятых Михаилом Касьяновым при работе на госслужбе, отмечает «Комсомольская правда», среди них строительство нефтепровода Ангарск – Дацин (утверждается, что в интересах Михаила Ходорковского), контракты с немецкой страховой компанией «Гермес», заключенные им на посту министра финансов.
«Будучи уже премьер-министром России, Касьянов подписал дополнения к межправительственному договору от 1994 года, согласно которым стал возможным перевод долга на коммерческой основе третьим лицам. В результате долг был выкуплен неизвестной коммерческой фирмой «Фалькон», выигрыш от сделки был распределен между РАО «ЕЭС России», погасившим свою задолженность по налогам в 1,35 млрд долл. всего за 550 млн долл., и неустановленными лицами, в числе которых называют и Касьянова».
Газета «Коммерсантъ» в материале 2003 года «Пришли за премьером» подробно рассказывает о деле банка «Траст», в материалах которого фигурировали Михаил Касьянов и близкие к нему люди: «Сотрудники Генпрокуратуры и ФСБ России начали проверку инвестиционного банка «Траст» (ранее – Доверительный и инвестиционный банк), принадлежащего МФО МЕНАТЕП. Как стало известно Ъ, следователей на этот раз интересовали не только финансовые операции, связанные с главой МФО Платоном Лебедевым, но и движение средств на счетах клиентов банка. А среди них – структура, близкая к премьер-министру России Михаилу Касьянову».