Криптой храма святого Димитрия в Салониках называется комплекс крытых галерей и коридоров, подпираемых мощными колоннами, находящимися под священным алтарем, – место, составлявшее восточную часть римских бань. В римскую эпоху это место находилось на одном уровне с землей, а сами бани были двухэтажные по причине наклонности поверхности. В последний период римского правления здание имело в своем центре источник с пятью углами, который окружался крытыми галереями. В V веке, после сооружения первого большого храма, часть бань, находившаяся на одном уровне с землей, включается в уже существующее помещение, обозначаемое местом мучения и называемое криптой.

В крипте был источник (он сохранился и по сей день в северной части храма), вода его почиталась святой. После X века источник стали связывать с миром, которое собирали верующие из цистерн разными емкостями – глиняными, стеклянными или металлическими. Среди них выделяются кутрувы – небольшие свинцовые чаши в форме раннехристианских просфор. Миро хранили и в больших сундуках, инкрустированных драгоценными камнями, в которых можно было перевозить его в дальние страны. Эти предметы развозились по всему христианскому миру.

В крипте находится также часовня, несколько расширяющаяся в ее восточной части. В раннехристианские времена это помещение было связано со святым источником, а также со святилищем храма. Предполагается, что это и было то самое место, где святой принял мученическую смерть.

Во времена турецкого владычества крипта была засыпана землей, и вновь ее находят лишь после пожара 1917 года, после чего начинается ее реставрация.

К полукруглому помещению апсиды был пристроен коридор с киворием, огражденный парапетами. Принимая во внимание исторические свидетельства о заключении и мученичестве святого Димитрия, это место римских бань с арками верующие стали считать священным, а вода из источников, находившихся в углах, была использована, скорее всего, в качестве священной воды, поскольку священная вода всегда была связана как с местами мучений, так и с храмами, которые были воздвигнуты там впоследствии.

Две отметки на поверхности пола недалеко от угла подтверждают точку зрения о существовании мраморной чаши или раковины, наполненной водой из текущего крана. Трубы, которые были обнаружены в результате археологических раскопок, ведут к источнику и к колодцу, находящемуся у левого пилястра святилища. По всей вероятности, эти трубы переносили святую воду из источника к углам крипты, до того как там появилось миро. Эта раковина сначала использовалась для сбора святой воды, а затем и миро, которое переносилось через свинцовую трубу из колодца, а затем через трубы под пол кивория.

Колодец, снабжавший водой римские бани, явился первой гробницей мученика. Именно туда было сброшено тело Димитрия солдатами римского императора, очевидно, с целью сохранить в тайне убиение столь популярного в народе человека.

Священники спускались по небольшой лестнице, находившейся с южной стороны священного алтаря, и через узкий вход заходили в мраморный коридор, защищавший источники со святой водой, и затем набирали эту святую воду для верующих.

В течение многих веков существования храма святые мощи святого Димитрия, защитника города Салоники, подвергались разным приключениям. Вначале мощи святого были перенесены и расположены в том месте, где сегодня находится шестиугольная основа кивория в храме святого Димитрия. На этом месте после прекращения гонений на христиан был основан небольшой храм, где собирались верующие, чтобы почтить великомученика.