После взятия Константинополя крестоносцами в 1208 году мощи были перевезены в Италию и помещены в кафедральном храме города Амальфи.
В 1462 году морейский деспот Фома Палеолог увёз главу и крест апостола из Патр, спасая их от турок, и передал на хранение Римскому папе Пию II, который поместил их в соборе Святого Петра.
В 1964 году папа Павел VI принял решение о передаче главы Андрея Первозванного и частиц Андреевского креста Элладской Православной Церкви, и эти реликвии были торжественно перенесены в Патры. В 1974 году здесь было окончено длившееся шестьдесят шесть лет строительство собора во имя Андрея Первозванного.
Современный собор Андрея Первозванного находится на том самом месте, где святой апостол обрёл кончину, рядом с источником, забившим на месте распятия.
На Афоне в Великой лавре Афанасия хранится рука апостола, в Андреевском скиту – частицы главы, в Пантелеимоновом монастыре – стопа.
В 1644 году иноки монастыря святой Анастасии Узорешительницы близ Фессалоник преподнесли в дар царю Михаилу Феодоровичу десницу апостола Андрея Первозванного, которая была положена в Успенском соборе Московского Кремля. К этому времени в Москве уже были части мощей, для которых в 1603–1604 годах по указанию Бориса Феодоровича Годунова был изготовлен серебряный ковчег-мощевик, помещённый в Благовещенском соборе Московского Кремля.
В настоящее время десница апостола Андрея хранится в Богоявленском соборе в Москве.
Семена спасительной веры, посеянные святым Андреем на пути его апостольских странствий, всходили и преображались в христианские общины, храмы и монастыри, претворялись в могучие «сеннолиственные древа» епархий и Поместных Церквей. Захолустный городишко Византий, для которого первозванный апостол рукоположил епископа, превратился в державный Царьград, красу и славу вселенского православия, и оттуда наконец благодать Божия достигла Русской земли.
Плодородной для апостольского посева была почва античных цивилизаций, взрыхлённая веками философских исканий, почва же древней Скифии казалась дикой и неплодной: жившие здесь племена не имели даже письменности для того, чтобы передать услышанное своим потомкам. Но вот прошло девять столетий – и таившееся в этой почве семя взошло, преображаясь в великое древо Русской Церкви. Крест Христов, некогда воздвигнутый святым апостолом Андреем на горах киевских, осенил благочестивых предков наших, даруя им любовь и мудрость, земную державность и вечное спасение.
Дорогие во Христе братья и сёстры!
Всероссийский пастырь, святой праведный Иоанн Кронштадтский говорит: «Служителями Себе в великом деле спасения человечества ипостасная Премудрость избрала не мудрых и не книжных людей века сего, а простых, смиренных, неучёных, бедных рыбарей, коих всё достояние на земле заключалось в рыбачьих лодках и сетях да в убогих хижинах… Чтобы удостоиться человеку получить от Бога благодать, премудрость и силу, нужна была способность к восприятию этих даров Божиих, нужна была простая, верующая, смиренная, не испорченная лукавством и всякими житейскими страстями цельная душа, способная быть носительницей благодати Божией, сверхъестественной премудрости и силы Божией… Для дела Христова нужны были люди ума и сердца возвышенного, самоотверженные, чуждые житейских пристрастий…
Апостолы обладали всем миром и повелевали всей твари, бесов прогоняли, всякие болезни исцеляли, воскрешали мёртвых, как бы пробуждая их от сна; вся природа преклонялась перед ними по воле и заповеди Господа, Которому они были искренними слугами, хотя потом и сами вкусили насильственную смерть от людей подобно Господу своему, благоволившему принять смерть от рук беззаконных и злонравных иудеев, но Своею смертию сокрушившему жало смерти всего рода человеческого…