Однако в отношении церковнослужителей – дьячков и пономарей – святителю пришлось куда сложнее. На эти должности на территории Войска Донского избирали вообще без ведома епархиальных властей особыми войсковыми грамотами, а лиц, посвященных и имевших грамоты от архиерея, не допускали к исполнению своих обязанностей. Не имея возможности лично справиться с таким положением дел в приходах донского казачества, святитель Тихон доносил об этом в Святейший Синод, прося содействия. Однако и распоряжения Святейшего Синода не всегда выполнялись.

В других областях Воронежской епархии дело с церковным причтом также обстояло не лучшим образом. И святителю Тихону также пришлось с этим разбираться. Проблема состояла в том, что в некоторых церквах не было причетников, а в это время внештатные причетники с семействами бедствовали. Святитель решил дело, зачислив внештатных причетников в штат и направив их в храмы, не имеющие причта.

Кроме того, нужно было что-то делать с уже имеющимся в наличии духовенством, в особенности с теми священниками, на которых было много нареканий. Святитель считал, что многие проблемы исходят от вопиющей богословской неграмотности. Вот как писал об этом он сам: «Являются ко мне многие священники и диаконы, которые крайне не знают Евангелия и Апостол. Из этого видно, что они или не имеют у себя Нового Завета, или имеют, да не читают, и как о своем, так и о порученных (ему) спасении нерадят, потому что в Новом Завете воля Отца Небесного возлюбленным Его Сыном Господом нашим Иисусом Христом открыта; итак, не читая Нового Завета, нельзя знать воли Отца Небесного, а не зная, невозможно исполнять, а от неисполнения воли Его святой следует явная погибель». [7] Поэтому он предписал всему духовенству, а также монашествующим ежедневное чтение Нового Завета.

На этом святитель Тихон не остановился – в первый год своего пребывания в Воронеже он пишет книгу «Должность священническая о седми Святых Таинствах», в которой подробно, с богословской точки зрения описывает семь Таинств Православной Церкви. Заканчивая объяснение каждого Таинства, святитель обращается с внушением к священникам, призывая благоговейно совершать Таинства и быть достойным посредником между Богом и людьми при раздаянии даров небесной благодати. Это сочинение, построенное в виде вопросов и ответов, стало как бы малым катехизисом для священников.

Желая противопоставить проповеди расколоучителей проповедь Православия, святитель Тихон резолюцией от 14 июля 1763 года предписал, чтобы после заамвонной молитвы на литургии каждый воскресный и праздничный день читать или Толковое Евангелие, или что-либо из Пролога, или из Следованной Псалтири и так далее.

Святитель Тихон постепенно осваивался на кафедре. Но проблемы оставались прежними – в частности кафедральный собор Воронежской епархии находился в плачевном состоянии: наружный и внутренний виды храма были крайне ветхи: позолота на куполах стерлась и главы почернели; многоярусный старинный иконостас обветшал, позолота и серебро на его столбах и резьбе полиняли, иконы как в нижних, так и в других ярусах были значительно повреждены, оклады местами отстали от досок, алебастровая работа по стенам отвалилась.

В 1764 году святитель Тихон обращается в Святейший Синод с просьбой разрешить строительство теплого кафедрального собора во имя Архистратига Божия Михаила и прочих бесплотных Сил. Видя же, что чиновники коллегии экономии по-прежнему затягивают дело с законными выплатами, он начинает сбор пожертвований.