Довольно долгое время структура судебной бухгалтерии складывалась из двух почти не взаимосвязанных разделов. Первый раздел, который именовался Общей частью, включал общие учетно—экономические знания и особенности бухгалтерского учета в различных отраслях экономики, во втором, нередко называемом Особенной частью, сообщались сведения о проведении ревизии и судебно—бухгалтерской экспертизы.

Несмотря на то что предпринимались попытки ориентировать структуру и содержание дисциплины на возрастающие запросы юридической практики, в ней длительное время доминировал экономический подход. Так, в учебнике, изданном в 1980 г., судебная бухгалтерия рассматривалась как специальная отрасль бухгалтерии, находящаяся на стыке теории бухгалтерского учета и уголовного (гражданского) процесса.[6]

Выпущенные в последние годы многочисленные учебные издания отражают многообразные взгляды различных авторов на структуру и содержание дисциплины. Ряд авторов (Т. М. Дмитриенко, А. А. Толкаченко, С. Г. Чаадаев и др.) преподносят структуру дисциплины в виде творческого приспособления защитных функций бухгалтерского учета к общим вопросам правоохранительной деятельности государственных органов. Гораздо более обширно возможности дисциплины представлены в работах С. П. Голубятникова, Е. С. Лехановой, С. Г. Еремина, где наряду с общими проблемами рассматриваются вопросы использования учетно—экономических знаний в основных хозяйственных операциях и ключевых отраслях экономики в целях выявления и доказывания преступлений.

Несмотря на относительно сложившуюся структуру судебной бухгалтерии и ее постоянное совершенствование, отдельные авторы представляют данную дисциплину в виде конгломерата трех не связанных между собой составляющих: теории бухгалтерского учета, аудита и экономической экспертизы.[7] Подобный подход к структуре этой дисциплины весьма сужает ее восприятие, поскольку обозначенные разделы не учитывают всего многообразия использования специальных бухгалтерских знаний, а особенности учета в отдельных отраслях экономики не ориентированы на современную юридическую практику.

В условиях разностороннего подхода к структуре дисциплины ориентирующей продолжает оставаться Примерная программа для образовательных учреждений высшего профессионального образования МВД России 2001 г., разработанная авторским коллективом Нижегородской академии МВД России. В ней структура судебной бухгалтерии определена в соответствии с содержанием рассматриваемой деятельности, при осуществлении которой анализ бухгалтерских документов всегда предшествует целенаправленному использованию возможностей документальной ревизии и судебно—бухгалтерской экспертизы. При этом объем предлагаемых обучаемым знаний дается в пределах, требующихся для понимания юристом основных вопросов дисциплины.

Структуру дисциплины «Судебная бухгалтерия» можно определить как логическое внутреннее построение определенной совокупности положений, отражающих содержание указанной дисциплины. Она предопределяет последовательное и поэтапное изучение содержательных элементов путем применения различных педагогических принципов.

Логическое построение дисциплины находит свое отражение в ее содержании, которое отображает формы (непосредственные и опосредованные) использования учетно—экономических и судебно—экономических знаний в процессе деятельности юриста при раскрытии и расследовании преступлений.

Общая структура дисциплины «Судебная бухгалтерия» наиболее часто включает следующие разделы: 1) общие положения судебной бухгалтерии и основ бухгалтерского учета, в котором рассматриваются предмет, задачи дисциплины, исследование документов и материалов инвентаризаций, общая характеристика учетного процесса и др.; 2) исследование документов и записей применительно к специфике учетных операций и отраслей рыночной экономики; 3) документальная ревизия и судебно—бухгалтерская экспертиза, где рассматриваются направления применения специальных бухгалтерских знаний.