С 1932 по 1936 год П. С. Жемчужина – управляющая трестом высшей парфюмерии (трест ЖирКость). С 1936 года занимала руководящие посты в Наркомате пищевой промышленности СССР: с июля 1936 года – начальник Главного управления парфюмерно-косметической, синтетической и мыловаренной промышленности. С ноября 1937 года – заместитель наркома, что свидетельствовало о ее незаурядных организаторских способностях, и это было, безусловно, замечено руководством страны и оценено при ее назначении на новые должности.

К тому же она была предана делу партии большевиков и ее вождю того периода И. В. Сталину, что и стало одним из важных фактов в ее назначении Народным комиссаром рыбной промышленности. Немалую роль сыграло и ее личное знакомство (даже на обыденном уровне) с самим Сталиным как подругой его жены (до кончины) Надежды Аллилуевой.

Однако свои организаторские способности П. Жемчужиной, как наркому рыбной промышленности, предстояло доказать в совершенно новой и незнакомой для нее рыбной отрасли, да еще и в организационный период, как самостоятельном государственном органе управления. А это по современным меркам не что иное, как Министерство рыбной промышленности всей страны. И она это доказала, опираясь на имеющиеся кадры, впитывая основы отрасли и особенности ее политико-экономического значения в различных водных бассейнах огромной страны.

П. С. Жемчужина активно и смело использует свой авторитет в партийных и правительственных кругах при решении тех или иных вопросов отрасли. Так, уже в апреле 1939 года она добилась награждения большой группы работников рыбной отрасли – передовиков – государственными наградами. Большинство из них – это труженики со всех бассейнов. Высшей награды страны – Орденом Ленина – были удостоены 24 работника отрасли, Трудового Красного Знамени – 57, Знаком Почета – 84, медалью «За трудовую доблесть» – 54, «За трудовое отличие» – 59 человек. Всего же были поощрены государственными наградами 278 специалистов и рыбаков отрасли. Среди них не было ни одного из заместителей наркома. Это было первое правительственное награждение большой группы тружеников рыбной отрасли разных специальностей – от рыбаков до капитанов – за годы советской власти. В последующем Полина Жемчужина неоднократно инициировала награждение и поощрение работников отрасли государственными наградами.

Сразу же после своего назначения она проводит 31 января 1939 года расширенную Коллегию Наркомрыбы. В ходе ее П. С. Жемчужина ставит задачу не только преодолеть отставание, допущенное рыбаками в 1938 году (плановое задание тогда было выполнено всего на 82,6 %), но и наращивать все показатели работы отрасли, как в ходе предстоящей весенней путины, так и в целом за год, с тем, чтобы обеспечить в 1939 году общий вылов рыбы и добычу морского зверя в объеме не менее 16 млн центнеров.

В последующем П. С. Жемчужина, выступая в марте 1939 года на XVIII съезде ВКП(б) как Народный комиссар рыбной промышленности и кандидат в члены ЦК ВКП(б) показала не только значение рыбной отрасли для обеспечения страны продовольствием, но и конкретно привела реальные факторы ее возможного роста и что следует сделать, чтобы это осуществилось. Причем сделала она это с анализом реальной обстановки на бассейнах – от Мурманска, Каспия до Камчатки, Сахалина и Приморья. В своем выступлении П. Жемчужина отметила и успехи советской рыбной отрасли за прошедший советский период:

«За годы советской власти отсталые рыбные промыслы, благодаря исключительной энергии Анастаса Ивановича Микояна, выросли в настоящую, технически вооруженную рыбную промышленность. Только за две сталинские пятилетки в рыбную промышленность было вложено свыше 4300 млн рублей. Средства эти были направлены на строительство рыболовного флота, судостроительных и судоремонтных заводов и верфей, на создание механизированных орудий лова, на строительство рыбных комбинатов, рыбных заводов, консервных заводов, холодильников, бондарных заводов и на культурно-бытовое строительство».