Именно с этого момента его стали преследовать неудачи. Длительный штиль задержал испанцев, и они не смогли вовремя достичь кубинских берегов. Только 22 августа галеоны вошли в порт Гаваны. К тому времени флот Новой Испании ужё ушёл, несмотря на строгие инструкции властей не отплывать флотам раздельно. Однако приближавшийся сезон ураганов не оставлял шансов командующему флотом Новой Испании, и он решил нарушить запрет.

Испанские моряки проклинали тропическую жару, от которой они страдали, пока стояли в ожидании отплытия. Огромное количество товаров, размещённых на судне, нагромождённых в самых неожиданных местах, делали помещения ужасно тесными и мешали передвижению. На борту «Нуэстра Сеньоры де Аточа» находился огромный груз. Согласно судовому манифесту, составленному капитаном Яном де Вредером, на борту находилось 24 тонны серебра в 1038 слитках, 180 тысяч песо в серебряных монетах, 125 слитков золота, 583 медных слитка, предназначенных для отливки пушек, 350 сундуков индиго, 525 тюков табака и 1200 фунтов серебряной посуды и бытовых предметов. Если прибавить к этому товары, вывозившиеся контрабандой, получается, что этот галеон был буквально перегружен ценностями.

В небольших каютах на корме разместились сорок восемь пассажиров – высшее общество Кастилии и Вест-Индии. Здесь были и королевский посланник в Перу отец Педро де ла Мадрис с двумя августинскими монахами, и коррехидор[1] города Куско Диего де Гузман, богатые перуанские торговцы Лоренсо де Арриола и Мигель де Мунибе и другие представители высшего общества.

Вдвое меньший груз золота и серебра находился на борту «Санта Маргариты». Однако на борту этого галеона находился губернатор Венесуэлы дон Франсиско де ла Хоса.

Командующий флотом долго ждал подходящего дня для отправки, затягивая отправление в Испанию. На совете капитанов было решено отплыть с началом новолуния, поскольку считалось, что это обеспечит благоприятную погоду. Только 4 сентября, на шесть недель позже намеченного срока, флот покинул Гавану. Этот день действительно выдался безоблачным и ясным, с приятным попутным ветром. Все двадцать восемь судов, с наполненными ветром парусами и развивающимися флагами и вымпелами, торжественно прошли мимо крепости Кастель-дель-Моро в открытое море.

Сезон ураганов только начинался, и испанские лоцманы надеялись, что флот успешно пройдёт опасный Флоридский пролив. Но этому не суждено было произойти. Уже на следующий день горизонт затянули тучи и усилился ветер. Старые и наиболее опытные моряки знали, что это предвещает начало урагана.

Флот из 28 кораблей, большинство из которых были небольшие торговые суда, разбросало на довольно большом пространстве. Вскоре ураган обрушился на них со всей своей яростью. Огромные волны, ломая мачты испанских кораблей, лишали их способности маневрировать на мелководье. Ветер, изменивший свое направление на южный, гнал галеоны на встречу отмелям в районе Драй-Тортугас, у побережья Флориды.

В этот момент большинство из тех, кто осознавал, что именно их ждёт, молились лишь о том, чтобы галеоны не вынесло на рифы – это означало бы немедленную гибель. Люди, обреченные на смерть, вели себя по-разному. Одни молились о спасении души, окружив кольцом священников, другие о спасении сокровищ. Капитан «Санта Маргариты» Гутьерре де Эспиноза приказал адъютанту положить в его личный сундук несколько золотых и серебряных слитков, столовое серебро и котелок с шоколадом. Затем сундук крепко перевязали так, чтобы он мог держаться на воде.

С наступлением темноты «Санта Маргарита» лишилась фок-мачты, которая рухнула за борт, порвав при этом такелаж и повредив корпус. Следом рухнула и грот-мачта, сделав судно совершенно беспомощным. Как и другие корабли флота, её быстро сносило на север.