Нестабильность региональных социально-экономических систем, подверженных действию многочисленных внешних и внутренних факторов требуют от готовности от управляющей подсистемы к изменениям. Это возможно только в том случае, если имеется прогноз по каждой динамической линии развития системы. В процессе принятия решений следует, учитывает не только динамику развития, но и ее способность к адаптации, к изменениям, а также возможные последствия принимаемых решений. В этом и проявляется принцип динамичности. Принятие решения в соответствии с принципом динамичности позволяет региональным системам адаптироваться к изменениям, поддерживая тем самым их жизнеспособность.

Принцип динамичности находится в тесной взаимосвязи с принципом мотивации, так как никакое развитие невозможно без соответствующих стимулов. В свою очередь, принцип мотивации является производным для принципа полной реализации, сущность которого заключается в отражении и наиболее полной реализации целей развития региональных систем.

Принцип вариативности предполагает формирование в региональных системах способностей к систематическому перебору вариантов их развития и адекватному принятию решений в ситуациях выбора. В настоящее время развитие региональных систем осуществляется в основном под влиянием экономических законов, которые в свою очередь, выражают наиболее существенные объективные и устойчивые связи, и тенденции развития экономических процессов и явлений.

Принцип интеграции хорошо просматривается в территориальном делении страны на федеральные округа, когда отдельные регионы интегрированы по территориальному, этническому, производственным и другим признакам. Данный принцип также предполагает уход от жесткой иерархической соподчиненности по вертикали, регионы каждый в отдельности равны, это делает равнозначным поведение элементов системы регионального управления в ходе их взаимодействия.

Принцип децентрализации означает, что принятие решений от центральных органов управления переходит к агентам рынка. Принцип ограничивает монополию регионального управления, обеспечивает экономическую свободу субъектов хозяйствования в регионе и полицентрическую систему принятия решений, а также обеспечивает передачу функций на региональный уровень [83].

Принцип оптимальности – это базовый общеэкономический принцип, согласно которому любое хозяйственное решение, вплоть до принятия плана социального и экономического развития страны или региона, должно исходить из задачи получения оптимального с точки зрения общенародных интересов результата. Оптимальность довольно тесно связана с принципом мобильности, так как только на основе быстрого реагирования системы на все проявления внешнего и внутреннего воздействия, возможно, ее устойчивое и сбалансированное развитие.

Производной принципа мобильности является последующая адаптивность, обозначающий неизбежное приспособление пространственно-локализованных систем к конъюнктурным макроэкономическим трансформациям.

Еще одним базовым принципом функционирования региональных систем является принцип эмерджентности, относящийся к принципам системного анализа. Это второй принцип У. Э. Эшби, который выражает важное свойство сложной системы, в качестве примера которой можно рассматривать регион: «Чем больше система и чем больше различия в размерах между частью и целым, тем выше вероятность того, что свойства целого могут сильно отличаться от свойств частей», то есть различия возникают в результате объединения в структуре системы определенного числа однородных или разнородных частей (элементов, отраслей, комплексов и т. д.) [91].