Авиация противника меняла приемы борьбы на наших морских сообщениях. Это заставляло соответственно менять и способы действия наших сил при защите своих коммуникаций. В начальный период войны, когда противник основной расчет делал на закупорку наших кораблей минными постановками в базах, авиация неприятеля на наших коммуникациях действовала главным образом одиночными самолетами и только в светлое время суток. Они применяли бомбометание с больших и средних высот с горизонтального полета. Точность такого бомбометания была очень низкой, и наши транспорты, совершавшие самостоятельные переходы без охранения и авиационного прикрытия, как правило, приходили в базы без повреждений[39].

Обычно авиация фронтов наносила удары по наступающим войскам противника, а привлекаемая авиация по более глубоким целям (резервам, объектам тыла, коммуникациям и др.). Взаимодействие с войсками ПВО при проведении оборонительных операций с целью прикрытия крупных военно-политических центров или важных стратегических объектов обычно организовывалось представителем Ставки. Ставка определяла зоны прикрытия для истребительной авиации воздушных армий и для истребительной авиации ПВО страны. Одновременно организовывалось взаимодействие между зенитной артиллерией и истребительной авиацией путем разделения зон боевых действий[40].

Осенью 1941 года на основании постановления Государственного Комитета Обороны (от 9 ноября) создаются специальные Войска ПВО на территории страны. В их состав вошли все соединения и части, прикрывавшие с воздуха фронтовые объекты и объекты тыла страны. В войсках согласно приказу НКО от 24 ноября 1941 года остались зенитные дивизионы (батареи) соединений и некоторые средства РГК: один зенитный артиллерийский полк, шестьдесят один дивизион, девятнадцать батарей, семнадцать пулеметных рот и взводов, а также мелкие подразделения ВНОС. В результате реорганизации Главное управление ПВО вошло в состав Войск ПВО территории страны, и в НКО не оказывалось другого органа, который осуществлял бы руководство противовоздушной обороной фронтов[41].

По мере улучшения управления войсками со стороны командования и штабов фронтов отпадала необходимость в стратегических направлениях. В конце 1941 и начале 1942 годов они были упразднены[42].

В апреле 1942 года Генеральный штаб внес в Ставку Верховного главнокомандования предложение о временном переходе к стратегической обороне с целью отражения возможного наступления противника на московском и юго-западном направлениях, выигрыша времени для подготовки резервов и создания тем самым необходимых условий для последующего перехода в наступление. Ставка ВГК, одобрив это предложение, потребовала провести наступательные операции под Ленинградом, на смоленском и львовско-курском направлениях, в районах Демянска, Харькова и в Крыму, чтобы сорвать готовящееся наступление врага и улучшить стратегическое положение[43].

Летом 1942 года, когда важнейшие оборонительные операции развернулись на юго-западном направлении, основная масса стратегических резервов была выдвинута на юг с целью восстановления прорванного фронта обороны[44].

Для создания сплошного фронта обороны на юго-западном направлении в течение июля – августа 1942 года Ставка передала фронтам из своего резерва шесть общевойсковых армий, две танковые и ряд отдельных соединений. Всего 26 стрелковых дивизий, 25 стрелковых бригад, 5 танковых и один кавалерийский корпус[45].

Стремительность наступления танковых армий, быстро и резко менявшаяся обстановка, трудности организации аэродромного маневра авиации вслед за наступающими танковыми войсками – все это требовало высокой оперативности, гибкости, непрерывности и твердости руководства авиационными соединениями, а также четкого согласования их усилий с действиями танковых армий по времени, месту и задачам