Содержание Евангелия от Иоанна по главам таково:
Глава 1: Учение о Боге Слове. Свидетельство Иоанна Крестителя об Иисусе Христе. Последование двух учеников Иоанновых за Господом Иисусом. Приход к Господу первых учеников: Андрея, Симона, Петра, Филимона и Нафанаила. Беседа Господа с Нафанаилом.
Глава 2: Первое чудо в Кане Галилейской. Изгнание торгующих из храма. Предречение Господа о разрушении храма Тела Его и о Его Воскресении из мертвых в третий день. Чудеса, совершенные Господом в Иерусалиме, и уверовавшие в Него.
Глава 3: Беседа Господа Иисуса Христа с начальником иудейским Никодимом. Новое свидетельство Иоанна Крестителя об Иисусе Христе.
Глава 4: Беседа Господа Иисуса Христа с самарянкой у колодца Иакова. Вера самарян. Возвращение Господа в Галилею. Исцеление сына царедворца в Капернауме.
Глава 5: Исцеление в субботу расслабленного при Овчей купели. Свидетельство Господа Иисуса Христа о Себе, как о Сыне Божием, имеющем власть воскрешать мертвых, и о Своих взаимоотношениях с Богом Отцом.
Глава 6: Чудесное насыщение 5 000 народа. Хождение по водам. Беседа о хлебе, сходящем с небес и дающем жизнь миру. О необходимости причащения Тела и Крови Христовых для наследования жизни вечной. Петр исповедует Иисуса Христом, Сыном Бога Живого. Предсказание Господа о Своем предателе.
Глава 7: Иисус Христос отвергает предложение братьев. Иисус Христос учит иудеев в храме на праздник. Учение Его о Духе Святом, как о воде живой. Распря о Нем среди иудеев.
Глава 8: Прощение Господом грешницы, взятой в прелюбодеянии. Беседа Господа с иудеями о Себе, како Свете мира и как от начала Сущем. Обличение не веровавших в Него иудеев, как желающих исполнять похоти отца своего – диавола, человекоубийцы искони.
Глава 9: Исцеление слепого от рождения.
Глава 10: Беседа Господа о Себе, как о «пастыре добром». Иисус Христос в Иерусалимском храме на празднике обновления. Беседа Его о Своем единстве с Отцом. Попытка иудеев побить Его камнями.
Глава 11: Воскрешение Лазаря. Решение первосвященников и фарисеев предать Господа смерти.
Глава 12: Помазание Господа миром Марией в Вифании. Вход Господень в Иерусалим. Эллины хотят видеть Иисуса. Молитва Иисуса Богу Отцу о прославлении Его. Увещание Господа ходить во свете, пока есть свет. Неверие иудеев по пророчеству Исаии.
Глава 13: Тайная Вечеря. Омовение ног. Предречение Господа о предательстве Иуды. Начало прощальной беседы Господа с учениками: наставление о взаимной любви. Предсказание отречения Петра.
Глава 14: Продолжение прощальной беседы о многих обитателях в доме Отца. Христос – путь, истина и жизнь. О силе веры. Обетование с ниспосланием Святого Духа.
Глава 15: Продолжение прощальной беседы: учение Господа о Себе, как о виноградной лозе. Увещание о взаимной любви. Предречение гонений.
Глава 16: Продолжение прощальной беседы: новое обетование о ниспослании Духа-Утешителя.
Глава 17: Первосвященническая молитва Господа об учениках Его и о всех верующих.
Глава 18: Взятие Господа в Гефсиманском саду. Суд у Анны. Отречение Петра. У Каиафы. На суде у Пилата.
Глава 19: Бичевание Господа. Допрос Пилата. Распятие. Бросание жребия воинами об одежде Иисуса. Иисус вверяет Свою Матерь Иоанну. Смерть и погребение Господа.
Глава 20: Мария Магдалина у Гроба с отваленным камнем. Петр и другой ученик находят Гроб пустым с лежащими в нем пеленами. Явление Воскресшего Господа Марии Магдалине. Явление Воскресшего Господа всем ученикам вместе. Неверие Фомы и вторичное явление Господа всем ученикам с Фомою вместе. Цель написания Евангелия.
Глава 21: Явление Господа ученикам при море Тивериадском, троекратное вопрошение Господа Петру: «Любиши ли Мя», – и поручение пасти овец Его. Предречение Петру мученической смерти. Вопрос Петра об Иоанне. Утверждение об истинности написанного в Евангелии.