Скелетная мышечная система у новорождённого анатомически сформирована и составляет 25% от всей массы тела. Новые мышечные волокна, вначале очень тонкие, не образуются, мышечная масса растёт за счёт утолщения существующих мышечных волокон. Сокращения мышц слабые и вялые. Мышцы удлиняются за счёт роста в зоне перехода мышечных волокон в сухожилие, где концентрируется наибольшее количество ядер. Между мышечными волокнами расположены кровеносные капилляры, связанные с мелкими внутримышечными артериями и венами. При гипертонусе напряжение в мышцах препятствует нормальному кровоснабжению и нервной проводимости. Мышечные спазмы блокируют движения суставов и приводят к изменению позы ребёнка. Напряжение в затылочной области связано с крестцовым отделом и приводит к ограничению движений ребёнка.

Нервный аппарат мышц к моменту рождения сформирован не полностью, что сочетается с незрелостью сократительного аппарата скелетных мышц. По мере роста ребёнка происходит созревание как двигательной иннервации фазных скелетных мышечных волокон (смена полинейронной иннервации на мононейронную, уменьшение площади чувствительности к ацетилхолину, в зрелых нервно-мышечных синапсах приуроченной только к постсинаптической мембране), так и формирование дефинитивных нервно-мышечных единиц. Происходит также образование новых проприорецепторов с концентрацией их на участках мышц, испытывающих наибольшее растяжение.

Костная ткань новорождённых содержит мало солей кальция, имеет порозное сетчатое строение, в ней много воды и мало плотного вещества, поэтому кости новорождённых отличаются упругостью, эластичностью и гибкостью (в связи с чем они легко деформируются). Кости новорождённых имеют богатую сосудистую сеть, что способствует хорошему кровоснабжению и энергичному протеканию процессов, обеспечивающих рост.

Кости черепа новорождённого тонки и гибки, закреплены эластичной соединительной тканью перемычек и перепонок, и легко могут принять другую форму (например, когда ребёнок лежит всё время на одной стороне). Швы между костями черепа формируются постепенно, а особое строение суставных поверхностей этих костей обеспечивает им хорошую подвижность, достаточно выражен лобный (метопический) шов между двумя половинками лобной кости.

Мозговой отдел черепа состоит из нескольких костей: затылочной, лобной, клиновидной, височной и теменной. Монолитная затылочная кость находится сзади, под теменной костью головы, у детей до 3—6 лет состоит из соединения 4-х частей: основной (базилярной), двух латеральных и затылочной чешуи, отделённых друг от друга полосками нежной, пластичной и способной деформироваться ткани. Эти 4 части будут постепенно сближаться друг с другом и окостенеют к шестому году жизни ребёнка, а у некоторых детей только к десятому году жизни. До окончательного окостенения эти части подвижны, скользят относительно друг друга, смещаются в сторону. Окостенев, они сформируют затылочное отверстие, через которое проходит спинной мозг, опускаясь из черепа вниз по позвоночнику. В черепе имеется несколько суставов.

Атлантозатылочный сустав (между первым шейным позвонком и черепом) укреплён связками, которые обеспечивают сгибание и разгибание (кивание головой) и боковое сгибание. Атлантоаксиальный сустав обеспечивает вращение атланта вместе с черепом вокруг вертикальной оси. Место соединения суставов наиболее уязвимо во время родов, когда могут случиться вывихи и подвывихи.

Парный височно-нижнечелюстной сустав соединяет нижнюю челюсть с нижнечелюстной ямкой и суставным бугорком височной кости. Движение в суставе происходит во всех трёх плоскостях: вверх и вниз, назад и вперёд, и вбок. Височно-нижнечелюстные суставы отвечают за все движения человеческого рта, помогают разговаривать и жевать. При травматическом напряжении мышц и подвывихе височно-нижнечелюстного сустава челюсти находятся в состоянии полуоткрытости. Нарушение баланса мышц приводит к значительным колебаниям из стороны в сторону при открытии или закрытии рта. Именно такая картина наблюдается у детей с ДЦП: асимметрия рта, затруднения в процессе жевания, глотания и произнесения слов.