Ахунбаев наряду с академиками А. Н. Бакулевым, Н. И. Колесниковым, С. Н. Амоссовым являются пионерами сердечно-сосудистой хирургии СССР.

Дружба с академиком Бакулевым, берущая начало еще в 1958—м году в Москве, позволила Ахунбаеву выполнить свою первую операцию на сердце в Москве. Через год, 19 мая 1959-го года, ему удалось то же самое совершить уже в Средней Азии – и это событие можно было в определенной степени стравнить с первым полетом человека в космосе: Иса Ахунбаев выполнил первую в Азии операцию на сердце человека, положившую начало развитию в регионе сердечной хирургии. Это было крупным достижением всего азиатского континента.

Плодом профессионального энтузиазма и дружбы между академиками Ахунбаевым и Бакулевым и бессменным лидером советской кардиохирургии академиком Бураковским явилась организация в Кыргызстане республиканского центра кардиохирургии (1976 г.), которое позже уже выросло до НИИ хирургии сердца (2004 г.).

Более 60 кыргызстанцев выросли как ученые в стенах НЦССХ имени Бакулева – все они сегодня вносят свою лепту в развитие сердечной хирургии, достойно работая в медицинских клиниках не только Кыргызстана, но и России, Казахстана, Израиля, Турции, США, Велибритании, Германии, Польши. Многие из них уже получили широкое международное призвание, являются членами престижных мировых научно-медицинских центров и обществ.

Следует особо отметить, что из них 15 специалистов, имеющие степени докторов и 22 кандидатов медицинских наук, защитили диссертации под руководством одного из выдающихся кардиохирургов современности, академика РАМН Лео Бокерии, директора Научного центра сердечно-сосудистой хирургии имени А. Н. Бакулева, Главного кардиохирурга Министерства здравоохранения РФ.

В знак уважения к нашей стране и памяти академика Исы Ахунбаева, а также продолжая славные исторические традиции дружбы и сотрудничества, целая делегация сердечно-сосудистых хирургов из России во главе с академиком Лео Бокерия, изъявили желание принять активное участие в юбилейной конференции и других акциях, приуроченных к этой знаменательной дате.

В течение недели кардиохирурги Кыргызстана и России провели совместные операции на сердце детям с врожденными пороками. Впервые в Центральной Азии Бокерия выполнил несколько уникальных операция новорожденным со сложными врожденными пороками.

Учитывая личную высокую заслугу перед народом Кыргызстана и высокий авторитет всемирно известного ученого-кардиохирурга, Президент Кыргызской Республики Курманбек Бакев принял у себя академика Бокерию и обсудил с ним перспективы развития и сотрудничества сердечно-сосудистой хирургии двух стран.

Эта встреча, безусловно, способствовала прогрессу медицины в стране и привела к решению некоторых очень важных проблем в медицинской отрасли Кыргызстана.

Лео Бокерия как один из основателей кыргызской кардиохирургии, воспитавший 15 докторов и более 30 кандидатов наук, был удостоен высокой государственной награды Кыргызской Республики – медали «Данк». Эта награда была вручена ему лично президентом КР Курманбеком Бакиевым в его кабинете, где он принимал почетного гостя из Москвы.

Во время встречи с главой республики выдающийся кардиохирург современности Лео Бокерия сказал о необходимости скорейшего

открытия в Бишкеке современного кардиохирургического центра, который поднял бы на совершенно новый уровень не только медицинское обслуживание больных сердечно-сосудистыми заболеваниями, но и способствовал реформированию важнейших отраслей отечественной медицины – кардиохирургии, кардиологии, торакальной и сосудистой хирургии.