Говоря об особых пограничных батальонах, придаваемых оперативным группам НКВД, следует отметить, что они являлись временными воинскими формированиями и номеров не имели. В начале ноября 1939 года, после выполнения возложенных на них задач, они были расформированы. Приказом НКВД СССР 2 ноября 1939 года для укомплектования вновь организованных областных Управлений НКВД на территории Западной Белоруссии и Западной Украины из состава особых пограничных батальонов было передано в их состав около 150 оперативных сотрудников и более 300 человек из лиц командно-начальствующего, младшего начальствующего и рядового состава пограничных войск для организации там комендантской службы.

Точно по такому же сценарию развивались события через несколько месяцев в ходе советско-финляндской войны, а также в период ввода частей и соединений Красной армии в Бессарабию и Северную Буковину. Также были созданы оперативные группы из числа сотрудников НКВД и политработников погранвойск, которые во взаимодействии с партийными и советскими работниками приграничных областей и республик, оказывали помощь «народным» правительствам в установлении новой власти в захваченных районах. В их подчинение также передавались особые батальоны пограничных войск для обеспечения деятельности указанных групп.

К примеру, 29 ноября 1939 года начальником особого отдела Ленинградского военного округа майором госбезопасности Сидневым подписано приказание, в котором говорится:

«Для выполнения специального задания назначаю оперативную группу… и 20 человек красноармейцев с четырьмя пулеметами. Транспорт – две грузовых автомашины.

Тов. Лавнееву подготовить группу к 24.00, иметь трехсуточный запас продовольствия и боевой комплект боеприпасов.

ЗАДАЧА: После занятия передовыми частями Красной армии населенного пункта Терийоки, прибыть в Терийоки, занять все государственные учреждения: телеграф, почту, радиоузлы, места заключения, полицейское управление и т.п., поставить охрану, изъять архивы, немедленно выбрать два лучших здания, освободить и привести в порядок для размещения народного Финляндского правительства, также выбрать место для размещения батальона триста человек».

Этим приказанием также был утвержден «План мероприятий по обеспечению операции 29 ноября 1939 года», в котором было предписано начальнику войск НКВД Ленинградского округа – комбригу Степанову (начальнику Ленинградского пограничного округа) выделить из 13-го мотострелкового полка один батальон, который после занятия Терийок поступает в оперативное подчинение начальника 1-го отдела УГБ УНКВД по Ленинградской области – капитана госбезопасности т. Антонова.

В НКВД по Карельской ССР в начале ноября 1939 года приказом наркома внутренних дел республики Баскакова был утвержден «Список оперативной бригады НКВД КАССР», состоявшей из штаба и 10 оперативных групп, которые в последующем активно действовали на территории Финляндии.

В докладной записке НКВД УССР в НКВД СССР от 3 июля 1940 г. «О работе оперативно-чекистских групп на территории Бессарабии» отмечается, что «…Оперативная группа т. Мартынова развернула свою работу в городах Северной Буковины.

По состоянию на 3 июля сего года арестовано 142 бывших работника полицейских и жандармских управлений…

По показаниям арестованных, вся верхушка административных и карательных учреждений Румынии с получением ноты Советского правительства стала эвакуироваться…

Оперативной группой т. Казина арестован 121 человек… Допросом устанавливается большое количество провокаторов среди Коммунистической партии Румынии… Оперативная группа т. Сазыкина работает в южном направлении. Всего оперативной группой арестовано 227 человек…