На основании приказа Наркома внутренних дел СССР от 08.09.1939 №001064 «Об оперативных мероприятиях в связи с проводимыми учебными сборами» из отряда было откомандировано около 200 пограничников на формирование четырех особых батальонов НКВД БССР.

11—15.09.1939 в отряд прибыло пополнение: курсанты полковых школ войск НКВД СССР, в т.ч. и Отдельной мотострелковой дивизии особого назначения им. Ф. Э. Дзержинского (ОМСДОН), 139 курсантов полковой школы 173-го стрелкового полка войск НКВД СССР по охране особо важных предприятий промышленности. Из них на базе отряда было сформировано девять боевых групп численностью 40—120 человек. В 5.00 17.09.1939 все группы перешли линию Государственной границы и внезапно напали на польские стражницы (заставы) и компании (роты).

Всего боевыми группами отряда было уничтожено 7 стражниц и 2 компании, при этом было убито 28 и взято в плен 62 польских солдат и сержантов. В качестве трофеев было взято все оружие, снаряжение и вся секретная переписка. Потери пограничников составили: убитых – 4 (заместитель политрука красноармеец Семен Антонович Вилюнов, командир отделения красноармеец Алексей Васильевич Стрепехов и стрелки красноармейцы Митрофан Яковлевич Богун, Григорий Петрович Кардаш), раненых – 11 (старший политрук Николай Анисимович Кириллов, начальник заставы старший лейтенант Николай Анисимович Земсков, секретарь бюро ВЛКСМ отряда младший политрук Иван Иванович Салащенко, командиры отделений Попутин, Никандр Тихонович Гилеев (Гилёв), Исаак Иосифович Остромогильский, Леонид Михайлович Шавалда (Шавальда), Афанасий Григорьевич Тютюниг (Тютюник), Сергей Павлович Орлов, Николай Петрович Круглов, Гричяненко).26

Убитые были похоронены в д. Заполье.

Указом Президиума Верховного Совета СССР от 26.04.1940 «за военные отличия по освобождению народов Западной Белоруссии и Украины» орденом Красного Знамени были награждены старший лейтенант Н.А.Земсков, красноармейцы С.А.Вилюнов, М.Я.Богун, А.В.Стрепехов и А.Г.Тютюник, орденом Красной Звезды – политрук Р. П. Кириллов, младший политрук И.И.Салащенко, красноармейцы Н.Т.Гилёв, Н.П.Круглов, С.П.Орлов, И.И.Остромогильский, Л.М.Шавалда. К награждению посмертно орденом Красного Знамени был представлен красноармеец Г.П.Кардаш.

После окончания освободительного похода личный состав боевых групп в отряд не возвратился, а был использован для обеспечения деятельности городских и уездных отделов НКВД, сформированных в Западной Беларуси.

Приказом Наркома внутренних дел СССР от 20.09.1939 №001121 УПВ НКВД БССР было приказано, дополнительно сформировав четыре новых пограничных отряда, принять под охрану новый участок Государственной границы СССР: н. п. Новое Село (на границе с Латвией) – н. п. Турмонг (на границе с Литувой) – стык границы с Восточной Пруссией у н. п. Гольце – по границе с Восточной Пруссией до р. Тисса – по р. Тисса до впадения ее в р. Висла – по р. Висла до реки Сан. Один из этих отрядов, 85-й, формировался на базе 13-го отряда.

С 16.10.1939 13-й Березинский отряд приступил к выполнению служебно-боевой задачи по охране зоны пограничного заграждения, установленной по линии прежней советско-польской границы.

Приказом Наркома внутренних дел СССР от 25.02.1940 №00246 «О мероприятиях по усилению охраны Государственной границы на участках Киевского и Белорусского пограничного округов» отряд включен в состав ПВ НКВД БССР.

Приказом Наркома внутренних дел СССР от 03.08.1940 №00941 был расформирован Плещеницкий пограничный отряд и его личный состав, участок зоны пограничного заграждения и узел связи (м. Плещеницы) были переданы 13-му Березинскому отряду. После этого отряд выполнял служебно-боевые задачи по охране зоны пограничного заграждения от стыка с 16-м Дзержинским (слева), до стыка с 83-м Малослободским (справа) отрядами.