• большая часть избирательных комиссий (ОИК, ТИК и УИК) стала формироваться вышестоящими комиссиями; председатели этих комиссий (ранее избираемые самими комиссиями) также стали назначаться;

• размещение в интернете данных протоколов УИК и вышестоящих избирательных комиссий.

В этот период удалось внести много новелл, направленных на защиту избирательных прав граждан, обеспечение честности и прозрачности подсчета голосов и подведения итогов голосования. Их инициаторами были главным образом депутаты от КПРФ и партии «Яблоко» (в Думе третьего созыва также СПС). ЦИК России, центристские фракции и президентская администрация обычно шли навстречу предложениям. Во многом это объяснялось тем, что в 1990‐х годах одной из главных забот федеральной власти стала борьба со своеволием региональных властей, и потому федеральная власть была готова устанавливать законодательные ограничения для злоупотреблений с их стороны. Эта тенденция еще сохранялась примерно до середины 2002 года.

Однако создание объединенной партии власти «Единая Россия» и подчинение глав регионов федеральной вертикали изменили ситуацию. Уже со второй половины 2002 года четко прослеживается тенденция к ограничению избирательных прав граждан. Ее проявлениями стали, в частности, увеличение заградительного барьера на выборах в Государственную думу с 5 до 7 % (норму приняли в 2002 году, но ее вступление в силу было отложено до выборов 2007 года), а для президентских выборов увеличение со 100 до 500 человек минимальной численности группы избирателей, которая должна быть создана в поддержку выдвижения кандидата, и с одного до двух миллионов – числа подписей избирателей, которое необходимо собрать для его регистрации.

После выборов 2003 года, когда «Единая Россия» получила в Государственной думе почти половину мандатов, а затем за счет присоединения к фракции большого числа одномандатников, избранных от других партий или в качестве независимых кандидатов, достигла квалифицированного большинства, началась избирательная и партийная контрреформа. Одним из первых ее проявлений стало ужесточение требований к политическим партиям. В декабре 2004 года приняли закон, увеличивший минимальное число членов партии с 10 до 50 тысяч. При этом на приведение своей численности к требуемому уровню партиям был дан всего год (до 1 января 2006). Одновременно закон обязал партии представлять в регистрирующий орган списки своих членов. Эти новеллы привели к резкому сокращению числа партий: если к 2004 году число партий, имевших право участвовать в выборах, достигло 46, то к середине 2007 года их осталось всего 15, а к 2009 году сократилось до 7.

Изменения избирательного законодательства в 2004–2007 годах были более радикальными, чем за предшествующие 10 лет. Фактически пересмотру подверглось большинство основополагающих принципов избирательной системы, сложившихся в 1993–1995 годах. Изменения включали:

• отмену прямых выборов глав регионов;

• перевод выборов в Государственную думу полностью на пропорциональную систему (при этом было подтверждено увеличение заградительного барьера до 7 %);

• лишение пассивного избирательного права российских граждан, имеющих гражданство иностранного государства или вид на жительство в иностранном государстве, а также имеющих судимость за тяжкие и особо тяжкие преступления;

• отмену института избирательных блоков, а затем и запрещение партиям выдвигать членов других партий;

• отмену права общественных объединений направлять наблюдателей на избирательные участки;

• проведение всех основных выборов в единые дни голосования – в марте и октябре (а в год выборов в Государственную думу – в декабре);