За провозглашением создания Словацкого национального совета последовала подготовка Словацкого национального восстания, которое возглавили бригадные генералы, офицеры чехословацкой армии Ян Голиан и Рудольф Виест.

Под руководством Голиана был разработан план вооруженного выступления словацкой армии против Германии при содействии советских войск, которые к этому времени уже устраивали антигитлеровские диверсии на словацкой территории. Партизаны занимали целые города и сёла, в связи с чем 29 августа 1944 года Германия начала оккупацию Словакии с согласия президента Тисо. Голиан дал команду к началу сопротивления, которое продлилось порядка двух месяцев. Повстанцы отбили территорию в Центральной Словакии, где была установлена власть Словацкого национального совета, но в результате отступили из центра сопротивления – города Банска-Бистрица, и переформировались в целях продолжения борьбы.