В соответствии с Федеральными законами от 01.12.2007 № 308-ФЗ, от 23.07.2008 № 160-ФЗ научная организация в соответствии с договором, заключенным с образовательным учреждением высшего профессионального образования, может создавать структурное подразделение (лабораторию), осуществляющее научную и (или) научно-техническую деятельность на базе образовательного учреждения высшего профессионального образования с учетом образовательных программ и тематики научных исследований, в порядке, определяемом уполномоченным Правительством Российской Федерации федеральным органом исполнительной власти.

Научная организация в соответствии с заключенным с образовательным учреждением высшего образования договором вправе предоставлять образовательному учреждению высшего образования в пользование движимое и недвижимое имущество, а также использовать движимое и недвижимое имущество, принадлежащее указанному образовательному учреждению на праве собственности или оперативного управления. Между такими государственными некоммерческими организациями указанные отношения могут осуществляться на безвозмездной основе.

Федеральными законами от 23.07.2008 № 160-ФЗ, от 27.07.2010 № 198-ФЗ уточнены правовые основы оценки квалификации научных работников и критерии этой оценки. Они определяются в порядке, устанавливаемом федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере научной и научно-технической деятельности, и обеспечиваются государственной системой аттестации.

Большое значение для развития инновационного предпринимательства в государственном секторе науки и образования имеет принятый Федеральный закон от 02.08.2009 № 217-ФЗ. В соответствии с указанным законом бюджетные и автономные научные и образовательные учреждения имеют право без согласия собственника их имущества с уведомлением федерального органа исполнительной власти, осуществляющего функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере научной и научно-технической деятельности, быть учредителями (в том числе совместно с другими лицами) хозяйственных обществ, деятельность которых заключается в практическом применении (внедрении) результатов интеллектуальной деятельности (программ для электронных вычислительных машин, баз данных, изобретений, полезных моделей, промышленных образцов, селекционных достижений, топологий интегральных микросхем, секретов производства (ноу-хау)), исключительные права на которые принадлежат данным научным учреждениям.

Правоприменительная практика Закона № 217-ФЗ показала необходимость внесения ряда поправок в федеральное законодательство в целях обеспечения деятельности хозяйственных обществ, созданных бюджетными научными и образовательными учреждениями. Одну из таких задач решает Федеральный закон «О внесении изменений в статью 5 Федерального закона “О науке и государственной научно-технической политике” и статью 17–1 Федерального закона “О защите конкуренции”». Предметом регулирования указанного закона является правовое обеспечение особого порядка сдачи в аренду движимого и недвижимого государственного или муниципального имущества государственных образовательных учреждений высшего образования или муниципальных образовательных учреждений высшего образования, государственных научных учреждений созданным этими учреждениями хозяйственным обществам с целью практического применения (внедрения) результатов интеллектуальной деятельности.

Федеральным законом от 27.07.2010 № 198-ФЗ были введены нормы, уточняющие правовой статус Высшей аттестационной комиссии. В целях обеспечения государственной аттестации научных и научно-педагогических работников Правительством Российской Федерации создается Высшая аттестационная комиссия при федеральном органе исполнительной власти, осуществляющем функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере научной и научно-технической деятельности, утверждаются Положение о Высшей аттестационной комиссии и состав указанной комиссии.