Руководство «Альтернативы» сознавая пагубную опасность, таящуюся в таком подходе при подготовке Учредительного съезда и для последующего партийного строительства, выступило на очередном заседании Оргкомитета против представительства на съезде нескольких региональных парторганизаций от одного региона. Оргкомитет благодаря конструктивной позиции некоторых не ангажированных его членов, искренне стремящихся к реализации намеченных задач, и прежде всего благодаря авторитету председателя Оргкомитета А. Н. Яковлева, признал аргументацию представителей ОФПД «Альтернатива». А. Н. Яковлев в качестве компромисса предложил дать полномочия делегатов учредительного съезда, каждой организации, участвующей в создании ПСД по 20 представителей. Все эти представители могли по желанию войти в одну уже созданную на тот момент или вновь создаваемую региональную организацию партии. Руководствуясь этой рекомендацией ОФПД «Альтернатива» дала указание своим активистам не создавать свои организации в регионах, где уже созданы региональные структуры партии, и войти в их состав своими представителями. Таких на тот момент, оказалось, пять регионов. К сожалению, так поступали не все политические организации, входящие в оргкомитет, это создавало ненужное напряжение среди инициаторов создания ПСД и как следствие мешало нормальной работе оргкомитета. Определённую тревогу вызывала поступающая информация о случаях активного участия в партийном строительстве пропрезидентских структур, т.е. представителей, власти на местах. Об этом свидетельствует и участие в этом процессе представителей президента в субъектах РФ. Так к представителю президента РФ по Красноярскому краю обратился исполнительный директор Оргкомитета Ю. В. Зайцев, который одновременно занимал должность помощника руководителя аппарата Президента РФ, с просьбой создать Красноярскую краевую организацию ПСД, зная что «Альтернатива в этом регионе провела уже такую работу. Вследствие этого в регионе были созданы две организации партии. Руководство ОФПД «Альтернатива» дала указание руководителю созданной ею организации, депутату Красноярского горсовета Г. Г. Кирпичёву встретиться с Ю. Н. Москвичём по вопросу объединения двух организаций в одну, что и было сделано. Ещё одним примером негативного восприятия некоторых политических организаций в частности КПСС, свидетелем, которого был представитель «Альтернативы в составе исполнительной дирекции Оргкомитета Зорин Д. К., стало запланированное в ответ на просьбу представителя Президента РФ по Кемеровской области посещение А. Н. Яковлевым г. Новокузнецка. Регион, взбудораживший всю страну в 1989 году протестными политическими выступлениями шахтёров, следствием которых стало заключение внутри региона между профсоюзами и руководителями крупнейших предприятий области «договора гражданского согласия». По достоинству оценив эту инициативу, А. Н. Яковлев дал согласие на приглашение приехать в Новокузнецк и встретиться с представителями профсоюзов предпринимателей и общественностью Кузбасса. На оказание содействия в организации и проведении этого мероприятия, «Альтернативой» по согласованию с исполнительной дирекцией Оргкомитета был направлен свой представитель, член исполнительной дирекции Зорин Д. К., ответственный за работу в регионах Сибири. Для организации работы А. Н. Яковлева в регионе была создана группа ответственных лиц, перед которой с заявлением выступил Представитель Президента Р. Ф. в Кемеровской области Малыхин, в котором было сказано буквально: «создание новой партии поддерживается Б. Н. Ельциным и его аппаратом, и как бы кто хотел, или не хотел партийная организация СПД в Кузбассе будет создана»