С низкой эффективностью работали селекционные центры по выведению высокоурожайных скороспелых, устойчивых к неблагоприятным погодным условиям, болезням и сельскохозяйственным вредителям сортов зерновых культур, особенно яровой пшеницы. Не проводилась их оценка на пригодность к интенсивным технологиям, вследствие чего на значительных площадях возделывались сорта пшеницы с повышенной степенью полегания и удлиненным вегетационным периодом. Опытно-производственные хозяйства не всегда обеспечивали колхозы и совхозы элитными семенами высоких кондиций. Научные работники оказывали слабое влияние на повышение качества обучения специалистов и механизаторов. Ученые недостаточно активно занимались внедрением хозрасчета и коллективного подряда в целях интенсификации производства зерна и земледелия в целом.

Узким местом в деятельности Сибирского отделения Всесоюзной академия сельскохозяйственных наук имени В. И. Ленина являлось внедренческая работа, укрепление связей с производством. Медленно создавались научно-производственные объединения.

Многие подведомственные отделению опытно-производственные хозяйства не стали для колхозов и совхозов образцом эффективного ведения хозяйства. При внедрении интенсивных технологий в них были допущены нарушения требований агротехники, некомплексно были проведены работы по защите растений, что привело к потерям значительной части урожая.

Эти ошибки и грубые технологические просчеты стали характерными для многих колхозов и совхозов Сибири. Лишь половина площадей яровой пшеницы была обработана гербицидами для уничтожения сорняков. Допущено было значительное поражение яровой пшеницы болезнями и вредителями. Выделенные для этих целей системные фунгициды остались неиспользованными.

Недостатки во внедрении интенсивных технологий не в полной мере учитывались при подготовке к полевым работам текущего года. Научно-исследовательскими учреждениями не были внесены уточнения и рекомендации по возделыванию сельскохозяйственных культур, не закончено формирование тематики исследований, не укреплены научными кадрами технологические подразделения. В опытно-производственных хозяйствах, колхозах и совхозах медленно велось обучение специалистов и механизаторов, ремонт техники, подготовка семян, вывозка на поля органических удобрений.

Партийные организации Сибирского отделения Всесоюзной академии сельскохозяйственных наук имени В. И. Ленина, научно-исследовательских учреждений не провели необходимой организаторской работы с научными сотрудниками по активизации их деятельности, более эффективному использованию возможностей региона для наращивания производства зерна. Многие коммунисты не сделали правильных выводов из требований ЦК КПСС по ускорению научно – технического прогресса, проявляли пассивность в работе, не способствовали созданию в коллективах обстановки творчества, высокой дисциплины и ответственности за порученное дело.

Президиум Всесоюзной академии сельскохозяйственных наук имени В.И.Ленина ослабил внимание к деятельности Сибирского отделения, не оказывал ему необходимой помощи в укреплении кадрами, развитии материально-технической базы, не осуществлял должной координации проводимых исследований.

Новосибирский обком КПСС, другие обкомы и крайкомы партии проводили недостаточную организаторскую работу и контроль за выполнением постановлений ЦК КПСС и Совета Министров СССР по интенсификации зернового хозяйства, слабо влияли на повышение уровня работы научно-исследовательских учреждений.

В постановлении ЦК КПСС было подчеркнуто, что важнейшей задачей Сибирского отделения Всесоюзной академии сельскохозяйственных наук имени В. И. Ленина, научно-исследовательских учреждений являлись безусловное выполнение решений апрельского и октябрьского (1985 г.) Пленумов ЦК КПСС по ускорению научно-технического прогресса в отраслях агропромышленного комплекса.