На рубеже XVII–XVIII веков Москва продолжала еще сохранять первостепенное значение в деле снабжения армии огнестрельным оружием и порохом. В распоряжении Приказа артиллерии было свыше 200 мастеровых и работных людей, из которых две трети были заняты изготовлением тяжелых орудий (пушек, мортир, гаубиц) и треть – изготовлением пороха. В это же время в селе Семеновском под Москвой, во дворе, принадлежавшем Меншикову, было организовано производство артиллерийских орудий нового образца. Но все больше предприятий, работавших на армию, возводили в новой столице империи, и Москва уступала ей пальму первенства.
При Петре I Москва перестала быть единственным центром монетного дела. Оно было организовано также в Петербурге и Екатеринбурге. Однако московские денежные дворы – Кадашевский, Набережный и Красный – продолжали свою деятельность, хотя и сокращали производство. Красный двор, располагавшийся около Воскресенских ворот Китай-города (один из его корпусов сохранился доныне), с 1697 года чеканил серебряные проволочные копейки, а с 1704 года начал чеканку серебряных рублей, полтин и полуполтинников. Кадашевский двор в Замоскворечье стал работать в 1701 году с чеканки золотых червонцев и серебряных монет нового образца. Набережный двор, располагавшийся на территории Кремля рядом с Боровицкими воротами, с 1700 года чеканил медные монеты всех достоинств.
Казенное производство постепенно повелением императора переходило в другие города. Так, в связи с начавшимся строительством новых оружейных и пороховых заводов в Петербурге, Туле, Олонце московская военная промышленность к началу 1710-х годов полностью свертывается, мастера Пушечного двора и Оружейной палаты переезжают в другие города.
Петр I, покровительствуя развитию частной инициативы в промышленности и торговле, передал компаниям московских купцов казенные фабрики и заводы. Только фабрики, непосредственно обслуживавшие армию и флот, остались в руках правительства.
В 1712 году по приказу Петра I граф Апраксин устроил в Красном селе мельницу для выделки писчей бумаги.
В Москве началось строительство частных мануфактур, за 11 лет (1714–1725) в ней возникло 21 частное предприятие в разных отраслях промышленности. Среди них явно преобладали текстильные (полотняные, шелковые, шерстяные). Многие из них работали на обеспечение армии. Москва становится крупнейшим центром текстильной мануфактурной промышленности России.
Москва почти полностью снабжала строящийся российский флот парусиной. Работал около Данилова монастыря с конца 1690-х годов до 1716 года и первый канатный завод, снабжавший Адмиралтейство добротными канатами, которые шли также на экспорт в морские державы Европы.
В связи с расширением каменного строительства начинают возникать также кирпичные заводы.
Москва издавна являлась центром торговли, и даже перенесение главной столицы в Петербург не изменило ее господствующего положения на всероссийском рынке. В ней насчитывалось до 150 торговых рядов. И хотя сохранялись их названия от прошлых веков, но расширение торговли разрушало их специализацию, их замкнутый характер. Распродажа оптом привозных товаров шла, как и раньше, преимущественно на Гостином дворе. В Китай-городе производилась основная торговля, здесь стояло более двух тысяч лавок, скамей, столов, рундуков.
Красная площадь утратила прежнее торговое значение, в начале своего царствования Петр I издал указ о том, чтобы на ней «лавки и шалаши, и всякое лавочное строение сломать… и никакими товарами и съестным харчем не торговать».
Хлеб, муку и крупы продавали в Мучном и Житном рядах за Москвой-рекой – на Болоте и Балчуге, лесом торговали на Бабьем городке, торговые ряды имелись также за Арбатскими воротами, около Сретенских ворот.