Для тропического климата островов характерно сезонное распределение количества осадков. В южных районах острова Сулавеси максимальное количество осадков приходится на декабрь-февраль, а в августе-сентябре осадки минимальны.
В северных районах острова максимум осадков выпадает в декабре-январе, в августе-сентябре – вдвое меньше. Влажность воздуха в среднем достигает 80 %, а временами доходит до 95 %. Характеры обильные ночные росы. Годовое распределение климатических характеристик отличается удивительным однообразием. Дневные температуры в течение года держатся обычно в диапазоне 30–35 °C, в ночные часы не опускаются ниже 23 °C. В горах на высоте 1500 м по ночам бывают заморозки до -2-3 °C, но в целом годовой ход температур столь же равномерен, как и в более низких поясах.
Являясь типичным лесным жителем, прекрасно приспособленным к жизни в условиях тропического влажного леса, малый желтохохлый какаду, тем не менее, избегает глухих первозданных участков леса. Он предпочитает селиться по окраинам лесов, по разреженным, осветленным участкам, по окраинам сельскохозяйственных угодий, плантациям кокосовых пальм. От влажных прибрежных равнин он поднимается в горы до высот в 800 м и лишь в некоторых местах его можно встретить на высоте до 1200 м.
Эти какаду встречаются обычно в парах и небольших стайках до 10 особей. Более крупные скопления можно увидеть только на кормежке, где какаду нередко объединяются с благородными попугаями. Шумные и заметные в таких скоплениях, желтохохлые птицы скрытны и малозаметны, когда передвигаются в кронах деревьев. Эти попугаи явно выделяются на фоне ярко-зеленой листвы, но сравнительно малозаметны в сухой сезон и в засушливых районах среди блеклой растительности.
Желтохохлых какаду часто видят парящими над кронами деревьев в поисках спелых плодов. Было замечено, что как только несколько попугаев опускалось на найденное дерево, к ним вскоре присоединялись и другие птицы.
Как и многие виды какаду, желтохохлые устраивают общественные ночевки на вершинах высоких деревьев, иногда вместе с благородными попугаями. Нередко подобные ночевки устраиваются в лесных массивах на окраинах городов и сел.
В ночном Сингапуре какаду можно встретить в ботаническом саду и, как утверждают наблюдатели, здесь птицы проявляют доверие к человеку, позволяя ему приблизиться к себе на близкое расстояние.
Птицы, покидающие ночевку, обычно передвигаются к местам кормежки на низких высотах. Кормятся желтохохлые какаду на деревьях, но спускаются и на землю, особенно когда перезревшие плоды лесных и садовых деревьев падают вниз. Рацион какаду обширен и включает разнообразные плоды, ягоды, цветы, почки деревьев, орехи. Кроме того, представители данного вида могут ловко обдирать оболочку и поедать довольно крупные кокосы. В сельскохозяйственных районах желтохохлые какаду нередко носят ущерб плантациям кукурузы, а в садах портят недозревшие фрукты, надкусывая их, но никогда не поедая.
С началом сезона размножения попугаи разбиваются на пары и занимают дупла, используемые многими поколениями птиц. Сезон размножения разный в отдельных частях ареала. На острове Бутон, например, размножение зарегистрировано в сентябре, на островах архипелага Нуса-Тенггара птицы гнездятся в апреле-мае.
Биология размножения малого желтохохлого какаду, как, впрочем, и других видов попугаев, изучена очень слабо. Некоторые детали этого процесса известны по птицам, размножающимся в условиях неволи. В кладке бывает до трех яиц, в насиживании принимают участие оба члена пары. Инкубация длится 28 дней. Птенцы покидают дупло через десять недель, но еще в течение двух месяцев или около того зависят от родителей, которые кормят и воспитывают их.