С начала 1950-х гг. стали организовываться самостоятельные кафедры криминалистики в высших учебных юридических учреждениях.

В 1944 г. в Москве открыли Центральную криминалистическую лабораторию Народного комиссариата юстиции, которая в 1946 г. вошла в состав Всесоюзного института юридических наук. В 1948–1951 гг. научно-исследовательские криминалистические лаборатории Министерства юстиции СССР появились в Ленинграде, Ростове-на-Дону, Хабаровске, Саратове, Свердловске, Новосибирске, Минске. В 1962 г. начал функционировать Центральный НИИ судебных экспертиз.

В 1946 г. в Москве был создан Научно-исследовательский институт криминалистики МВД СССР (в 1969 г. преобразован во ВНИИ МВД СССР).

В феврале 1949 г. учредили ВНИИ криминалистики при Прокуратуре СССР, который обобщал следственную и экспертную практику, занимался совершенствованием научно-технических средств и методов борьбы с преступностью. В 1963 г. он был переориентирован на изучение причин и разработку мер предупреждения преступности, а в 1989 г. – на решение проблем укрепления законности и правопорядка.

В 1954 г. в органах прокуратуры была введена должность прокуроров-криминалистов и образованы кабинеты криминалистики.

Третий этап (1970–1991 гг.) характеризуется нарастанием интенсивности формирования общей теории отечественной криминалистики. К этому времени был накоплен богатый эмпирический материал, послуживший основой для углубленных науковедческих изысканий. Общая теория стала той базой, которая обеспечила рост значимости криминалистики, содействовала всестороннему исследованию сущности предварительного расследования, оперативно-разыскной деятельности, судебной и экспертной деятельности, дальнейшей разработке и совершенствованию средств, методов и приемов борьбы с преступностью. Все направления криминалистической науки, ее частные теории и учения обогащались благодаря обращению к психологии, социологии, теории вероятностей, логике, прогностике, кибернетике, моделированию, информатике, другим передовым направлениям развития научной мысли.

Поступательное развитие российской криминалистики привело к выделению из нее в качестве самостоятельных отраслей знаний теории ОРД и судебной психологии. Возникли направления, связанные с применением в криминалистике положений кибернетики, психолингвистики, теории игр, информатики, теории моделирования. Стали развиваться новые виды криминалистических экспертиз, разрабатываться приемы и методы использования в расследовании преступлений специальных знаний самого широкого спектра.

Общая теория криминалистики способствовала дальнейшему развитию учения о планировании расследования, выдвижении и проверке криминалистических версий. Объектом изучения стала природа следственных действий, начал разрабатываться ряд новых перспективных направлений: учения о следственных ситуациях, криминалистических операциях, тактических комбинациях, алгоритмизации и программировании расследования.

Методика расследования отдельных видов преступлений также углубила и расширила свои основы, полнее определила исходные положения, в т. ч. предмет, систему, принципы и задачи, место в структуре науки.

В 1977–1979 гг. Р. С. Белкиным был издан первый отечественный фундаментальный труд «Курс советской криминалистики» в 3 томах.

Политические и социально-экономические преобразования, произошедшие во всех сферах жизни страны на рубеже 1980–1990-х гг., оказали значительное влияние на структуру и динамику преступности, что побудило российских ученых вновь обратиться к теоретическим и методологическим проблемам науки и одновременно искать отвечающие запросам практики решения прикладных задач.