Финансирование и обеспечение деятельности военных судов также исключают какую-либо их зависимость. В соответствии со статьей 32 Федерального конституционного закона «О военных судах Российской Федерации» финансирование военных судов и обеспечение их всем необходимым, как и других судов общей юрисдикции, осуществляется за счет средств федерального бюджета Судебным департаментом при Верховном Суде Российской Федерации.

Гарантии самостоятельности военных судов и независимости судей закреплены в статье 5 Федерального конституционного закона «О военных судах Российской Федерации». Согласно ее положениям военные судьи осуществляют правосудие самостоятельно, подчиняясь только Конституции Российской Федерации, федеральным конституционным законам и федеральным законам. Судьи военных судов независимы и в своей деятельности по осуществлению правосудия никому не подотчетны. Гарантии независимости судей, установленные Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами и федеральными законами, не могут быть отменены или снижены в отношении судей военных судов. Всякое вмешательство в деятельность судей военных судов по осуществлению правосудия недопустимо и влечет ответственность, предусмотренную федеральным законом.

Так, в соответствии с Уголовным кодексом Российской Федерации предусмотрена уголовная ответственность за: клевету в отношении судьи (ст. 298); вмешательство в какой бы то ни было форме в деятельность суда в целях воспрепятствования осуществлению правосудия (ст. 294); посягательство на жизнь лица, осуществляющего правосудие (ст. 295); угрозу убийством, причинением вреда здоровью, уничтожением или повреждением имущества в отношении судьи (ст. 296).

При отправлении правосудия военные суды руководствуются не специальными нормами материального и процессуального законодательства, а едиными для всех судов страны Уголовным, Гражданским, Уголовно-процессуальным, Гражданским процессуальным кодексами и другими законами.

Вынесенные военными судами решения по уголовным и гражданским делам, а также по административным правонарушениям в отношении военнослужащих, так же как и решения иных судов общей юрисдикции, могут быть обжалованы в установленном процессуальном порядке.

Следует также отметить, что в соответствии со статьей 1 Федерального конституционного закона «О военных судах Российской Федерации» военные суды, как и иные суды общей юрисдикции, создаются и упраздняются только федеральным законом. Количество военных судов и численность судей военных судов устанавливаются Верховным Судом Российской Федерации.

Анализ конституционно-правового статуса военных судов свидетельствует о том, что на законодательном уровне установлена обязательность принятых ими решений по рассматриваемым делам и это обеспечивается силой закона, что делает наиболее эффективной их деятельность по укреплению военной дисциплины, правопорядка в частях, боеготовности и боеспособности воинских частей и обеспечению национальной безопасности.

Так, в соответствии со статьей 6 Федерального конституционного закона «О судебной системе Российской Федерации» вступившие в законную силу постановления судов являются обязательными для всех без исключения органов государственной власти, органов местного самоуправления, общественных объединений, должностных лиц, других физических и юридических лиц и подлежат неукоснительному исполнению на всей территории Российской Федерации. При этом неисполнение постановления суда, а равно иное проявление неуважения к суду, влекут ответственность, предусмотренную федеральным законом.