Собранные при этом доказательства подвергаются судом (судьей) тщательному исследованию. Полученные и исследованные (проверенные) судом (судьей) доказательства могут привести его к версии, отличающейся от следственной, что может вызвать необходимость отложения и приостановления судебного разбирательства (ст. 253 УПК РФ), принятия решения о прекращении уголовного дела (ст. 254 УПК РФ) и т. д.

Но в рассматриваемой стадии уголовного процесса основное внимание уделяется, как правило, проверке и оценке доказательств и их источников, собранных органами предварительного расследования. Это обусловлено предметом судебного разбирательства. Согласно ч. 1 ст. 252 УПК РФ «судебное разбирательство проводится только в отношении обвиняемого и лишь по предъявленному ему обвинению».

Объясняется это тем, что суд основывает приговор лишь на тех доказательствах, которые были рассмотрены в судебном заседании. Только эти доказательства являются объектом оценки суда (судьи) и участников судебного разбирательства. Именно в результате оценки доказательств суд (судья) отвечает на главный (основной) вопрос всего уголовного процесса – виновен или не виновен подсудимый.

Производимую судом (судьей) оценку доказательств нельзя сводить только к завершающей оценке, что должно происходить в совещательной комнате. Суд (судья) уже при исследовании обстоятельств обязан проверить правильность и обоснованность выводов, сделанных на более ранних стадиях уголовного процесса, соответствие оценки доказательств предварительного следствия объективным обстоятельствам преступления и требованиям закона.

Суд (судья) не связан с оценкой доказательств, которая была дана на предварительном следствии, а осуществляет ее самостоятельно. Оценка доказательств производится в течение всего судебного следствия. В ходе судебного следствия судом выясняется ценность, значимость доказательств. Судьи не пассивно выслушивают показания свидетелей, обвиняемых, заключения экспертов, ожидая момента удаления в совещательную комнату для оценки доказательства и постановления приговора, а наоборот, активно исследуют каждое доказательство по делу, сопоставляя с фактически имеющимися в деле или истребуя новые доказательства.

В ходе судебного следствия оценка доказательств ведется каждым судьей в отдельности. Активно участвуя в судебном следствии, судьи уже в ходе судебного заседания составляют определенное мнение о достоверности, о других ценностных свойствах каждого из исследуемых доказательств. Однако оценка доказательств в процессе судебного следствия является предварительной. Окончательную оценку достоверности, значимости каждого доказательства суд (судья) может дать только на основе оценки доказательств в их совокупности. Суд (судья) должен тщательно исследовать все доказательства по делу, как изобличающие, так и оправдывающие подсудимого. Неисследование какого-либо доказательства, имеющего существенное значение для выяснения искомых фактов, является нарушением принципа оценки доказательств в их совокупности.

Оценка доказательств в их совокупности играет важную роль в формировании судейского убеждения по делу. Внутреннее убеждение судей не складывается само собой, оно вырабатывается в результате внимательного изучения и тщательной проверки всех материалов дела.

В процессе оценки доказательств в судебном заседании у судей появляются определенные суждения относительно фактов, подлежащих установлению по делу. Но эти суждения не являются окончательными, так как они неоднократно могут изменяться под влиянием других доказательств. Одни из них могут подтверждать ранее сформировавшиеся суждения об обстоятельствах уголовного дела, другие – ставить их под сомнение, третьи – вовсе отрицать.