В 1713 году Петр Великий «указал в Казанской и Азовской губерниях басурманам магометанской веры, за которыми есть поместья и вотчины и в тех их поместьях и вотчинах за ними крестьяне и дворовые, и деловые люди православной христианской веры., сказать свой Великого государя указ, чтобы они, басурманы, крестились, конечно, в полгода; а как воспримут святое крещение, и теми поместьями, и вотчинами, и людьми, и крестьянами владеть по- прежнему. А ежели они в полгода не крестятся, и те их поместья, вотчины с людьми и с крестьянами у них взять и отписать на него Великого Государя, и без указу никому не отдавать; а сколько человек из тех 6асурман воспримут святое крещение и сколько человек не крестятся, и что у таких поместий и вотчин отписано будет: о том в канцелярию Сената прислать из тех губерний ведение». (Ислам в Российской империи. Законодательные акты, описания, статистика// Составитель и автор вводной статьи. Комментариев и приложений Д. Ю. Арапов. М., 2001. С. 42).
Был принят также царский наказ, предписывающий не допускать обращения в ислам соседних с татарами народов: мордвы, чувашей, черемисов, остяков, вотяков и др. (Там же. С. 43).
Сенатским Указом от 19 ноября 1742 года все вновь построенные мечети, а также мечети, построенные там, где проживали православные, было велено «сломать и впредь отнюдь не допущатъ», а обращенных в ислам «всеми удобовозможными способами разведать, а кто явится, сыскивать накрепко, кем и из какой веры или народа к Магометанскому закону обращены и в вере их утверждены, и по следствию на кого покажут и сыщется про то допряма, чинить с таковым, как вышеозначенным пунктом повелено, а чувашам и другим всякого звания превращенным, ежели они по призыванию и добровольному увещанию креститься не пожелают, чинить штраф по указам же…». (Там же. С. 43—44). Подобная политика продолжалась до конца XVIII века. (Гусева Ю. Н. История исламских общин Нижегородской области… С. 7—13).
Как мы видим, отношение победившей стороны было совершенно противоположной тому, что было при «владычестве татар». Если завоевание Руси (татарами) стало «эпохой расцвета русской культуры», то при завоевании Казанского ханства началась насильственная христианизация и истребление народа, который сократился, как пишет Равиль Гайнутдин на 4/5. Это страшная цифра, свидетельствующая о бесчеловечном геноциде.
В дальнейшем был принят ряд законодательных актов, направленных на облегчение существования и деятельности мусульманских общин, издание религиозной литературы, подготовки кадров служителей ислама. Однако вплоть до Октябрьской революции в Российской империи ислам никогда не являлся равноправной с православием религией. В стране всегда господствовал принцип, сформулированный известным государственным деятелем К. П. Победоносцевым (1827—1907 гг.), возглавлявшим Святейший Синод: «Государство признает одно вероисповедание из числа всех истинным вероисповеданием и одну церковь, исключительно покровительствует и поддерживает к предосуждению всех остальных церквей и исповеданий», вплоть до приравнивания отпадения от православия к уголовному преступлению. (Никольский Н. М. История Русской Церкви. 3-е изд. М., 1983. С. 428—429).
Православная церковь была господствующей и пользовалась особым покровительством Царского правительства, в том числе материальным. Ничего подобного, разумеется, по отношению к исламу, правительство не допускало. Ислам относился к числу «терпимых» религий. Но при этом права мусульман и их организаций были по многим вопросам серьезно ограничены. Ограничения касались многих аспектов деятельности мусульманских организаций. В частности, среди мусульман православные миссионеры могли распространять свою религию, а мусульманские деятели такого права не имели.