Во время выдвижения кандидатов на пост Председателя Думы трое претендентов (Е. Примаков (ОВР), В. Похмелкин (СПС) и С. Степашин («Яблоко»)), а также председатель группы «Регионы России» О. Морозов выразили своё возмущение «сговором»^>109. Фракции ОВР, СПС и «Яблоко» объявили об отказе от дальнейшего участия в работе пленарного заседания Думы.

Председателем Госдумы был избран Селезнёв, занимавший этот пост в парламенте второго созыва. Его заместителями были утверждены: Л. Слиска («Единство»), П. Романов (КПРФ), В. Жириновский (ЛДПР), Г. Семигин (АПГ), В. Аверченко (НД).

Парламент принял 279 голосами при одном «против» и одном воздержавшемся постановление о комитетах, предусматривающее создание 27 комитетов и Мандатной комиссии^>110. Новое пакетное соглашение выявило тенденцию к снижению влияния коммунистической фракции. В Госдуме второго созыва фракция КПРФ контролировала девять комитетов и Мандатную комиссию, их союзникам по Аграрной группе и депутатской группе «Народовластие» принадлежало ещё пять комитетов. В Госдуме третьего созыва коммунистам удалось закрепить за собой посты председателей девяти комитетов и Мандатной комиссии, но союзникам в лице Агропромышленной депутатской группы досталось только два комитета. Был утерян контроль над тремя комитетами.

Конъюнктурный союз КПРФ и прокремлёвских сил оказался шатким из-за серьёзнейших идеологических противоречий между участниками этой коалиции. Расхождение во взглядах КПРФ и Кремля на основные вопросы внутренней и внешней политики привело к радикализации деятельности коммунистов: «Учитывая реальное соотношение сил в Государственной Думе, фракция КПРФ в первую очередь вынуждена бороться за сохранение существующих трудовых прав граждан, защиту прав пенсионеров, детей, инвалидов и ветеранов, повышение заработной платы работников бюджетной сферы, отбивая попытки Правительства и подконтрольных ему депутатских групп ликвидировать или в значительной мере урезать их»^>111.

В феврале Г. Зюганов направил обращение руководству страны и профсоюзам по поводу фактов вооружённого захвата предприятий в различных частях страны^>112.

21 февраля увидел свет документ «Путём созидания. Основные направления экономической программы народно-патриотических сил», ключевые идеи которого заключались в увязывании социальной справедливости и динамичного экономического развития, в построении социально-ориентированной рыночной многоукладной экономики, во внедрении современного планирования (не директивного), в защите государственности^>113.

26 марта прошли выборы главы государства, на которых победу одержал В. Путин (52,94 %), а Г. Зюганов набрал 29,21 %^>114. На следующий день Г. Зюганов выступил с заявлением по поводу итогов голосования, в котором указал, что по данным параллельного подсчёта голосов (по 36 % протоколов) В. Путин набрал 44,8 %, на основе чего лидер Компартии задал направление готовиться ко второму туру^>115. Окончательные результаты выборов не дали КПРФ реализовать такой сценарий.

В апреле коммунисты отметили 130 лет со дня рождения Ленина^>116. В области внешней политики коммунисты заявили о несогласии с договором об ограничении стратегических ядерных сил страны (СНВ-2)^>117.

20 мая собрался пленум ЦК. Партия признала свою стратегическую ошибку на прошедших выборах (отсутствие привлекательной «национальной идеи»), назвала целью Путина «охрану награбленного» командой Б. Ельцина, опасалась установления диктатуры^>118.

Летом из НПСР были исключены М. Лапшин, А. Тулеев и А. Подберёзкин. КПРФ стала владельцем «контрольного пакета» в данном объединении. Исполком возглавил член Агропромышленной депутатской группы, вице-спикер Думы Г.Ю. Семигин.