Только что созданные красные части были не в состоянии удержать контроль над территорией. 4 сентября 1918 г. Дальсовнарком и его войска оставили Хабаровск, отступив в Амурскую область. В сентябре фронтовые действия прекратились и перешли в партизанскую войну.

22 октября 1918 г. владивостокское Временное правительство автономной Сибири передало свои полномочия созданному в Омске ВСП – Временному Всероссийскому правительству (так называемой Директории). Однако ВСП просуществовало недолго. 18 ноября 1918 года адмирал А.В. Колчак, военный и морской министр Временного Сибирского правительства, был провозглашён в Омске «Верховным правителем России». Адмирал Колчак сравнительно быстро установил свою власть в Сибири и на Дальнем Востоке. Верховным уполномоченным его правительства с резиденцией во Владивостоке стал генерал Д.Л. Хорват, в июле 1919 г. его сменил генерал С.Н. Розанов, ставший главным начальником края.

Сейчас в РФ пытаются романтизировать роль «Омского правителя». Однако сам Колчак писал своей метрессе Анне Тимирёвой: «30.XII.1917 г. Я принят на службу Его Величества короля Англии». А вот отрывок из другого письма: «Сингапур. 16 марта [1918 г. – А.Ш.]. Встречен распоряжение английского правительства вернуться немедленно в Китай для работы в Маньчжурии и Сибири. Оно нашло, что использовать меня там в видах союзников и России предпочтительно перед Месопотамией».

Британский генерал Нокс, курировавший Колчака в Сибири, после войны открыто признал, что англичане несут прямую ответственность за создание правительства Колчака.

Надо ли говорить, что Верховный правитель «made in England» не вызвал особого энтузиазма в Токио.

21 ноября 1918 г. Генштаб японской армии указал генералам Отани и Оба на необходимость укрепления политического и военного положения Японии на Дальнем Востоке путём поддержки «автономных русских учреждений», «командования местными войсками» и генерала Д.Л. Хорвата. Сразу же после этого атаман Семёнов прервал телеграфное и железнодорожное сообщение между Сибирью и Дальним Востоком, объявив о принятии на себя всей власти на территории Забайкальской и Амурской областей и на территории Уссурийского казачьего войска. 28 ноября 1918 г. японский Генштаб известил союзных военных атташе, что «все слухи о причастности Японии к объявлению Семёновым независимости Восточной Сибири не соответствуют действительности».

Но когда адмирал Колчак издал приказ об отрешении Семёнова от всех должностей и направил в Читу отряд под командованием полковника Волкова, командование 3‐й японской дивизии, расквартированной в Забайкалье, отказалось его пропустить. В конфликт попытались вмешаться союзные представители во Владивостоке, но и им японцы заявили, что не допустят смещения Семёнова, поскольку его отряды «поддерживают спокойствие в местах их расположения». Атаман И.П. Калмыков, обосновавшийся в Хабаровске, проводил аналогичную политику, направленную на создание казачьей автономии на Дальнем Востоке.

Временное правительство осенью 1917 г. сформировало корпус из военнопленных чехов и словаков. Сделано сие было в нарушение всех Гаагских конвенций, запрещавших формирование военных частей из военнопленных.

До марта 1918 г. Чехословацкий корпус дислоцировался в тылу Юго-Западного фронта. Корпус состоял из двух дивизий и запасного батальона (численностью около 30 тыс. человек). Командовал корпусом генерал В.Н. Шокоров, начальником штаба был назначен генерал М.К. Дитерихс.

Несмотря на заявления о невмешательстве в политическую борьбу в России, командование корпуса и руководство Чехословацкого национального совета (Филиал в России; ЧНС) поддерживали российские контрреволюционные силы – украинскую Центральную раду, Добровольческую армию, организации Б.В. Савинкова и правых эсеров.