Большую часть времени у команды занимали строительные работы, но этим не ограничивалась жизнь поста. Основной задачей, поставленной Г. И. Невельским, являлось обследование и описание местности, изучение нравов, обычаев, верований коренного населения, оказание им помощи. Необходимо было также определить «не найдётся ли тут удобной гавани», так как с открытием навигации следующего года необходимо было поставить один или два поста. С этой задачей блестяще справился Николай Васильевич Рудановский.

К сожалению, у Рудановского и Буссе отношения сложились далёкими от взаимопонимания и сотрудничества. Личные амбиции Буссе, как правило, брали верх над интересами дела. А. П. Чехов, изучая историю освоения Сахалина перед поездкой на остров в 1890 году, сразу выделил главное в отношениях офицеров Муравьёвского поста. Называя Буссе «нервным, неуживчивым господином», он с иронией отмечал: «Зимуя с Рудановским в Аниве и будучи старше его чином, майор назойливо требовал от него чинопочитания и соблюдения всех правил субординации, и это в пустыне, почти с глазу на глаз, когда молодой человек весь был погружён в серьёзную научную работу» [72].

Из 250 дней, проведённых на Сахалине, Н. В. Рудановский 140 провёл в поездках по острову. Он писал: «Южная часть Сахалина между 46˚ и 48˚ параллелями широты, на протяжении более 600 вёрст была в эту экспедицию пройдена мною или на гребном судне или же на собаках, причём, сделано подробное исследование его в географическом, статистическом и климатическом отношениях» [73].

6 октября с пятью матросами, на шлюпке, Рудановский отправился в первый маршрут. Продовольствие было взято на неделю, и поднявшись примерно на 70 километров по реке Сусуе и обследовав её берега, он вернулся. Новое путешествие по Сусуе длилось с 14 по 25 октября. На этот раз Рудановский сделал полное описание реки и селений по её берегам. Он писал Невельскому: «По качеству почвы (большей частью чернозёмной), по изобилию леса, превосходных лугов и обилию в реках всякого рода рыбы долина реки Сусуи весьма удобна для основания земледельческих поселений, в особенности между Кой [74] и Экураки [75], где берега реки ровные, возвышены и, по словам жителей, никогда не заливаемы весной; толщина чернозёмного слоя на глинистой и песчаной подпочве доходит до 2½ до 3½ аршин» [76].

Уже 29 октября Рудановский с тремя матросами, двумя казаками, проводником-айном отправились на лодке в новое путешествие. На этот раз необходимо было описать берег залива Анива и озеро Буссе. Одновременно со вторым путешествием Рудановского приказчик Российско-Американской компании Д. И. Самарин совершил путешествие к айнскому селению Сиретоку, расположенному почти на самой оконечности мыса Анива. Он принёс важные известия. У селения Тообучи была расположена прекрасная гавань – озеро лагунного типа. Самарин назвал его именем Буссе. Он привёз известие, что недалеко от Сиретоку должны быть россыпи золота. Приказчик Розанов, бывавший на приисках в Сибири, определил, что камни, привезённое Самариным, показывают присутствие золота. Теперь к южной оконечности мыса Анива и отправился Рудановский со спутниками, взяв запас продовольствия на 15 суток. Эту часть побережья ещё никто не исследовал. Описывали берега со шлюпки, ночевали в айнских посёлках. Прибыв в селение Тообучи, Рудановский сделал промеры глубин озера Буссе и описал его. Было обнаружено довольно удобное место для стоянки судов с осадкой до 16 футов. По мнению Рудановского берега озера были удобны для основания поселений. Перейдя перевал, Рудановский вышел к Охотскому морю. 12 ноября он вернулся в пост Муравьёвский. Обработав материалы, составил карту, воспроизводящую береговую линию от поста до мыса Анива со всеми мысами, ручьями и речками, глубинами озера Буссе по всей его площади.