Учёные «Аненербе» добились достаточно весомых результатов и в других нетрадиционных областях знаний: в психотронике, парапсихологии, в использовании «тонких» энергий для управления индивидуальным и массовым сознанием и т. п. Солидное финансирование позволило привлечь к научным исследованиям многих первоклассных университетских ученых. По заданию руководства Германии археологами «Аненербе» были произведены раскопки укреплений викингов IX века, состоялись экспедиции в Тибет и на Ближний Восток, позднее осуществлялись исследования и охрана древних поселений и курганов в оккупированных южных частях Украины.

1 января 1939 общество «Аненербе» получило новый статус, которым на него были возложены научные изыскания в области медицины. В целях более тесной связи с военными нуждами рейха в обществе в 1940 году был создан «Институт прикладных военных исследований». С началом Второй мировой войны медицинские исследования нашли своё продолжение в экспериментах, непосредственно проводимых на людях в концлагерях Дахау, Аушвиц (Освенцим), Бухенвальд и других, особенно часто для проведения медицинских экспериментов, связанных с изучением поведения человеческого организма в экстремальных условиях, привлекали советских военнопленных. Медицинские эксперименты занимали важное место в «научной» работе Института прикладных военных исследований. Так, например, доктор Йозеф Менгеле из концентрационного лагеря Освенцим занимался проблемой увеличения германской нации. В этом аспекте его чрезвычайно интересовали близнецы. Непосредственно под его руководством проводились операции, во время которых предпринимались попытки сшить вместе детей, чтобы создать сиамских близнецов. Однако данный эксперимент не удался. В женском концлагере Равенсбрюк под руководством доктора Герты Оберхейзер сотням молодых и здоровых девушек умышленно наносили раны, доводя до гангрены, или проводили эксперименты по пересадке костей. С целью сокрытия следов чудовищных операций тела «пациентов», как правило, сжигались в печах крематория, а пепел вывозился на поля в качестве удобрения. В Дахау и Бухенвальде проводились исследования по изучению возможностей человеческого организма нормально функционировать в условиях, когда человек для питья использует только морскую воду. Кроме того, в лагере Бухенвальд врачами Хольцленером и Рашером проводились эксперименты по исследованию сопротивляемости человеческого организма к температурам замораживания, а профессор Брандт, один из личных врачей Гитлера, проводил исследования, связанные с проблемами ведения химической войны. Во многих лагерях широко проводились опыты по стерилизации мужчин и женщин. Эсэсовский врач, доктор Адольф Покорны, в одном из своих отчётов писал рейхсфюреру СС Гиммлеру: «… врага необходимо не только победить, но и искоренить. В тех случаях, когда его не нужно убивать, то его следует лишить возможности воспроизводить себя. Сама по себе мысль о том, что три миллиона большевиков, находящихся сейчас в немецком плену, могут быть стерилизованы и в то же время будут пригодны для работы, открывает далеко идущие перспективы». Эти перспективы в конечном итоге выразились в законе о стерилизации, позволявшей германскому государству решать – стерилизовать или не стерилизовать индивида по расовым соображениям.

Экспериментальным материалом при разработке расовой доктрины, являлись узники немецких концентрационных лагерей. Вполне очевидно, что, как и при любом выявлении достоинств одной расы перед другой процесс сравнения не может осуществляться односторонне. Проводимое нацистами концепция «сверхчеловека», в первую очередь была призвана доказать и продемонстрировать уникальные духовные, физические и интеллектуальные возможности и особенности «истинных арийцев».