Все же оказалось, что Берхтольд не слишком подходит для роли руководителя новой самостоятельной организации в рамках НСДАП. Он постоянно стремился заниматься еще и политической, журналистской деятельностью и в январе 1927 г. стал редактором центрального печатного органа партии газеты Völkischer Beobachter («Фёлькише обозреватель»). Постоянные столкновения Берхтольда с руководством СА и гаулейтерами завершилась полной неудачей – партию потрясали кризисы, и Гитлеру важнее было объединить движение вокруг себя, победив конкурентов, а не потакать амбициям рейхсфюрера СС. После этого Берхтольду ничего не оставалось как 1 марта 1927 г. подать в отставку. На этом карьера Берхтольда в СС закончилась, и в дальнейшем она шла исключительно по партийной линии и СА.

До января 1933 г. Берхтольд оставался на достаточно влиятельном посту редактора Völkischer Beobachter. В 1928 г. также зачислен в штаб Высшего руководства СА в Мюнхене в качестве офицера СА (SA-Führer), назначен квартирмейстером (офицером Ib) Информационного штаба Верховного руководства СА и главным редактором газеты SA-Mann («Штурмовик»). Квартирмейстером Берхтольд был недолго – до 1931 г., а вот газетой СА он руководил до 1938-го. 18 декабря 1931 г. ему было присвоено звание штандартенфюрера СА.

В январе 1933 г. Берхтольд возглавил редакцию Völkischer Beobachter в Мюнхене (штаб-квартира газеты до самого краха Третьего рейха размещалась именно в этом городе) – т. е. он стал не главным редактором, определявшим политическое направление газеты, а главой редакции, человеком, руководившим редакционным процессом. В это же время 1 января 1933 г. он был произведен в оберфюреры СА. Позже Берхтольд постепенно повышался в чинах, став бригадефюрером (9 ноября 1934 г.), группенфюрером (1 мая 1937 г.) и, наконец, обергруппенфюром СА (30 января 1942 г.).

В марте 1934 г. Берхтольд был избран членом Мюнхенского городского совета, став, таким образом, влиятельным политиком на региональном уровне. Первоначально после прихода Гитлера к власти Берхтольд не получал каких-либо особых назначений, сохранив, правда, все свои прошлые. Однако уже 1 октября 1935 г. Йозеф Берхтольд стал главой городского совета Мюнхена (Ratsherr der Stadt München), 15 ноября 1935 г. – членом Имперского сената культуры, а 29 марта 1936 г. избран депутатом Рейхстага от 32-го округа (Баден). В целом Берхтольд, несмотря на столь многообещающее начало карьеры, остался хоть и обеспеченным и влиятельным, но все же не очень крупным региональным партфункционером без всякой надежды на занятие высших должностей в рейхе. В январе 1938 г. Берхтольд получил новое повышение – он стал заместителем главного редактора Völkischer Beobachter по Баварии и Южной Германии, но карьера его явно катилась к своему закату. Перед началом Французской кампании Берхтольд 29 апреля 1940 г. поступил добровольцем в вермахт и получил чин капитана резерва. Служба его протекала в основном в тыловых частях, а в декабре 1942 г. он был комиссован по состоянию здоровья и вернулся в Мюнхен. Но и здесь ему уже не было места и в феврале 1943 г. Берхтольд оставил работу в Völkischer Beobachter, отошел от дел и уехал в свой дом в Оберпфаффенхофене – небольшом городке в 20 км от Мюнхена. В январе – мае 1945 г. ему еще раз привелось проявить некоторую активность – он был назначен командиром отрядами фольксштурма в своем городишке.