Генерал КГБ СССР В. П. Воротников, который находился в этом регионе, с самого начала массовых беспорядков, 21 июня 1995 года в интервью газете «Подмосковные известия» сказал: «Благодаря совместным действиям КГБ, МВД и прокуратуре удалось нормализовать обстановку, возбудить 78 уголовных дел. Все проходившие по этим делам были направлены в места изоляции, откуда их через полгода выпустила власть, бесконечно меняющая свое лицо. После чего эти люди стали носить имидж борцов с коммунизмом и возглавили узбекскую аппозицию». На вопрос корреспондента: «А кто мог отдать приказ выпустить уголовников на свободу?» В. П. Воротников ответил: «Команды в регионы поступали от союзного руководства».

Выступая 19 августа 1988 года на 16-м Пленуме ЦК КПУЗ И. А. Каримов, ставший первым секретарем ЦК партии Узбекистана, заявил, что утверждения о существовании каких-либо националистических центров, ставивших целью захват власти в республике, являются бездоказательными. После этого выступления в печати высокопоставленных чиновников о «заговоре» в Фергане практически прекратились. После выхода из состава СССР Узбекистана, И. А. Каримов стал президентом этой республики и проявил себя как националист и человек, прибравший к рукам значительную часть общественных богатств. В СНГ он стал фигурой, преследующей только свои корыстные цели. Тысячи узбеков и таджиков, возможно участвовавших в массовых выступлениях националистического толка, получили от новой власти нищету и бесправие, оставили семьи уехали на заработки в Россию.

События в Узбекистане стали некой пробой сил. Были отработаны методы управления толпой, подвергнутой дезинформации о конечных целях выступлений. Надо не забывать, что затеянный Горбачевым референдум о сохранении Советского Союза как единого государства потерпел фиаско. Люди не хотели разделяться. Прибалтийские республики требовали лишь предоставления им большей самостоятельности. Но именно Яковлев рекомендовал им выйти из состава СССР. Еще ничего не произошло, а МВД Прибалтийских Республик получили от министра внутренних дел Бакатина право действовать по своему усмотрению, не согласовывая свои действия с союзным министерством. Как следствие, возникло требование ко всем живущим в Прибалтийских Республиках гражданам общаться только на национальных языках и неповиноваться распоряжениям правительства СССР.

Когда начались выступления в Грузии, высшая власть страны в лице ЦК КПСС и президента СССР Горбачева бросила руководителей на произвол судьбы и растерзание толпы. То, что это шло с самого верха, подтверждается событиями, связанными с Карабахом. С одной стороны, конфликт разжигался комитетом «Карабах», находящимся в Армении, с другой стороны, национальным фронтом Азербайджана. Когда Михаил Сергеевич Горбачев побывал в Армении после Спитакского землетрясения и увидел, какая вакханалия творилась в отношениях сторон, он приказал разобраться в сложившейся обстановке. После принятия определенных мер под руководством Прокуратуры СССР все виновники событий – члены комитета «Карабах» и национального фронта Азербайджана – были задержаны, против них возбуждены уголовные дела и велось следствие, а потом вдруг последовала команда: всех подозреваемых освободить.

Горбачев, с одной стороны, был Генеральным секретарем коммунистической партии, но им уже преданной, с другой стороны – руководителем вылезающего из небытия подполья.

Его главнейшей задачей была помощь этим людям, когда для них возникала опасность разоблачения. Он всесторонне оберегал «агентов влияния», продвигал их на ключевые места в целях развала страны. Характерным примером в данном случае является указание секретарю ЦК компартии Грузии Патиашвили не привлекать к уголовной ответственности экстремистов, выступающих с антисоветскими и антисоциалистическими лозунгами. И хотя для их привлечения к ответственности были все правовые основания, Горбачев предложил подождать до принятия нового Закона.