Органы казначейства имеют право:

производить в министерствах, ведомствах, иных органах исполнительной власти, в хозяйствующих субъектах, использующих средства федерального бюджета, государственных внебюджетных фондов, проверки денежных документов, регистров бухгалтерского учета, отчетов, планов, смет доходов и расходов, связанных с зачислением, перечислением и использованием федерального бюджета, государственных внебюджетных фондов;

требовать устранения выявленных нарушений порядка исполнения федерального бюджета, государственных внебюджетных фондов;

приостанавливать операции по банковским счетам организаций (по лицевым счетам бюджетных организаций в органах Федерального казначейства) в случаях непредставления (или отказа предъявить) органам казначейства бухгалтерских, финансовых документов, связанных с использованием указанных средств;

выдавать обязательные для исполнения предписания о взыскании с организаций в бесспорном порядке (инкассовое поручение) средств, выданных из федерального бюджета и используемых не по целевому назначению с применением к ним соответствующих санкций;

налагать на кредитные организации штрафы в случае несвоевременного зачисления им средств, поступающих в федеральный бюджет, в государственные внебюджетные фонды, либо несвоевременного перечисления средств из федерального бюджета, государственных внебюджетных фондов на счета получателей этих средств;

вносить в Банк России представления о лишении соответствующих кредитных организаций лицензий на совершение банковских операций.

Бюджетным кодексом РФ установлена ответственность за нарушение бюджетного законодательства органами Федерального казначейства за:

правильность исполнения федерального бюджета, ведение счетов и управление бюджетными средствами;

финансирование расходов, связанных с предоставлением бюджетных ссуд, бюджетных кредитов, бюджетных инвестиций, государственных гарантий с нарушением порядка, установленного Бюджетным кодексом РФ;

полноту и своевременность перечисления бюджетных средств получателям бюджетных средств, своевременность предоставления отчетов и других сведений, связанных с исполнением бюджета;

своевременность доведения уведомлений о бюджетных ассигнованиях и лимитов обязательств бюджета до получателей бюджетных средств;

финансирование расходов, не включенных в бюджетную роспись; финансирование расходов сверх утвержденных лимитов обязательств бюджета.

Федеральное казначейство несет ответственность за осуществление контроля за соблюдением бюджетного законодательства Российской Федерации главными распорядителями, распорядителями и получателями бюджетных средств, а также кредитными организациями. Бюджетный кодекс РФ специально предусматривает ответственность Федерального казначейства за исполнение предписаний Счетной палаты Российской Федерации и решений актов судебных органов о компенсации (возмещении) ущерба, нанесенного финансовыми органами, получателями бюджетных средств.

В соответствии с Федеральным законом от 25 сентября 1997 г. № 126-ФЗ «О финансовых основах местного самоуправления в Российской Федерации» в целях управления местными финансами представительные органы местного самоуправления вправе создавать органы местного казначейства.

Федеральная служба финансово-бюджетного надзора находится в ведении Министерства финансов Российской Федерации и осуществляет свою деятельность на основании Положения, утвержденного постановлением Правительства РФ от 15 июня 2004 г. № 278. Федеральная служба финансово-бюджетного надзора является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по контролю и надзору в финансово-бюджетной сфере, а также функции органа валютного контроля.