Хотя в труде Тритемия были описаны много шифров – как существующих в то время, так и изобретённых самим автором, она была пронизана каббалистическими и оккультными аллюзиями.

В результате книга вызывала гнев многих монарших дворов Европы, которые думали, что Тритемий выдал в ней слишком много тайн. Кроме того, Римская католическая церковь считала труды Тритемия еретическими и в 1609 году внесла его книги в список запрещенных. Это запрещение длилось 250 лет.

В 1541 году книга была переиздана на французским языке, а вскоре был сделан её перевод на немецкий язык. В этой книге Тритемий сделал два новаторских предложения в криптологии: шифр «Аве Мария» и шифр, построенный на основе периодически сдвигаемого ключа.

Шифр «Аве Мария» основывался на принципе замены заранее оговоренных слов на буквы шифротекста. С таких слов складывалось внешне «невинное» сообщение. Например, заменим буквы «А», «К», «Т» на такие слова: «А» – ожидаю, мой; «К» – дома, ключ; «Т» – я, здесь. В таком случае позитивный тайный ответ на заданный вопрос может иметь несколько вариантов: «Я ожидаю дома» или «Здесь мой ключ».

Вторым более серьезным шифром была «таблица Тритемия» – квадратная таблица размером 24х24 со многими алфавитами, названная «tabula recta». Алфавиты были записаны в строки таблицы один под другим, причем каждый из них был сдвинут на одну позицию влево по сравнению с предыдущим.

Тритемий предлагал использовать эту таблицу для многоалфавитного шифрования самым простым из возможных способов: первая буква текста шифровалась первым алфавитом, вторая буква – вторым и т.д. В этой таблице не было отдельного алфавита открытого текста, для этой цели служил алфавит первой строки. Таким образом, слово «UKRAINE» превращалось в шифротекст «ULTDNSL».

Преимущество этого метода шифрования по сравнению с методом Альберти заключалась в том, что каждая очередная буква текста шифровалась новым алфавитом. Альберти изменял алфавиты лишь после трёх или четырёх слов. Поэтому его шифротекст состоял из отрезков, каждый из которых имел закономерности открытого текста, которые помогали расшифровать криптограмму. Побуквенное шифрование не давало такого преимущества (см. таблицу).

Кроме того, Тритемий предлагал также использовать одноалфавитное шифрование с помощью квадрата Полибия и ключевого слова – пароля. Выбиралось какое-либо слово, из него убирались повторяемые буквы, а оставшиеся записывались в первые клетки квадрата. Пустые клетки заполнялись оставшимися буквами алфавита по порядку.

Рассмотрим эту систему шифрования, таблица которой будет иметь размер не 5х5, а 5х6. Буква шифрования берётся из клетки, находившейся под клеткой буквы сообщения. Поскольку ключевое слово легко было запомнить, то такой подход упрощал процессы шифрования и дешифрования. Для ключа «ШИФРОВКА» таблица будет иметь такой вид (см. таблицу).

Для вышеописанного шифра по данной таблице сообщение «УЖГОРОД» даёт шифровку «ЫСМДГДН». Такие табличные шифры были названы монограммами, потому что шифрование велось по одной букве.

Тритемий также первым заметил, что можно шифровать одновременно по две буквы, которые стояли рядом и были названы «биграммой». Такой шифр был назван «биграммным». Опишем его на примере той же таблицы. Открытый текст разбивался на биграммы, а текст шифровки выходил из него в соответствии с такими правилами:

1. Если обе буквы биграммы исходного текста принадлежали одному столбцу таблицы, то буквами шифра считались буквы, которые были под ними. Так, биграмма «БУ» давала текст шифровки «ЛЫ». Если буква открытого текста находилась в нижней строке, то для шифра бралась соответствующая буква из верхней строки: биграмма «ЯЩ» давала шифр «ВШ» (биграмма из одной буквы или пары одинаковых букв тоже подчинялась этому правилу).