Согласно информации, размещенной на официальном сайте Министерства обороны республики, «в интересах обеспечения национальной безопасности Кыргызской Республик органы национальной безопасности:

1. Осуществляют разведывательную и контрразведывательную деятельность; ведут борьбу с разведывательно-подрывной деятельностью специальных служб иностранных государств и организаций, терроризмом, коррупцией, контрабандой и наркобизнесом; участвуют в защите конституционного строя, суверенитета и территориальной целостности Кыргызской Республики от противоправных посягательств.

2. Разрабатывают и осуществляют меры по выявлению, предупреждению и пресечению преступлений, расследование которых отнесено законодательством Кыргызской Республики к ведению органов национальной безопасности; осуществляют оперативно-розыскные мероприятия, дознание и предварительное следствие в отношении лиц, совершивших преступления или подозреваемых в их совершении, в том числе с использованием оперативно-технических и других средств; ведут учет этих лиц.

3. Организуют систему защиты государственных секретов, представляют по запросам компетентных органов власти информацию на отдельных лиц в связи с решением, в установленном порядке, вопроса о допуске к секретным сведениям.

4. Участвуют в разработке мероприятий и осуществляют меры по обеспечению безопасности объектов оборонной промышленности, транспорта, связи, финансово-кредитной системы и других важных народно-хозяйственных объектов, перечень которых определяет Правительство Кыргызской Республики; участвуют в обеспечении безопасности специальных перевозок на железнодорожном и воздушном транспорте.

5. Проводят совместно с научно-исследовательскими организациями исследования и прогнозирование развития общественных процессов и проблем, затрагивающих интересы национальной безопасности; ведут информационно-аналитическую работу в целях удовлетворения потребностей разведки и контрразведки; осуществляют разработку, производство и эксплуатацию автоматизированных информационно-аналитических систем.

6. Участвуют в мероприятиях по предупреждению, пресечению и локализации массовых беспорядков и межнациональных конфликтов, чрезвычайных происшествий на важных народно-хозяйственных и военных объектах.

7. Оказывают содействие пограничным войскам в охране Государственной границы Кыргызской Республики.

8. Разрабатывают и осуществляют в соответствии со своей компетенцией мероприятия по обеспечению готовности к функционированию в военное время пунктов управления Кыргызской Республики, организуют и обеспечивают собственную мобилизационную подготовку.

9. Разрабатывают и осуществляют меры по обеспечению безопасности во внутренних войсках, других военных формированиях и объектах, дислоцированных на территории Кыргызской Республики.

10. Осуществляют оперативные меры по обеспечению безопасности проводимых на территории Кыргызской Республики важных государственных и общественно-политических мероприятий; участвуют в охране государственных и общественных деятелей других государств в период их пребывания в республике, а также совместно с органами внутренних дел – отдельных дипломатических представительств зарубежных стран, аккредитованных при органах государственной власти Кыргызской Республики.

11. Осуществляют меры по обеспечению безопасности дипломатических представительств, консульских и других государственных учреждений Кыргызской Республики и ее граждан за границей.

12. Принимают участие в разработке мер по вопросам выезда за границу граждан Кыргызской Республики, а также въезда-выезда иностранцев и лиц без гражданства, их перемещения по территории республики.