Росприроднадзор и его территориальные органы имеют право запрашивать у проверяемого юридического лица или индивидуального предпринимателя путем направления мотивированного запроса дополнительные сведения, если содержание представленных на проверку документов вызывает сомнение или не отражает все необходимые сведения. К запросу прилагается заверенная печатью копия распоряжения или приказа руководителя, заместителя руководителя Росприроднадзора (либо его территориального органа) или его заместителя о проведении документарной проверки.

Однако контрольный орган не вправе требовать у юридического лица, индивидуального предпринимателя сведения и документы, не относящиеся к предмету документарной проверки. Проверяемый хозяйствующий субъект обязан представить в контрольный орган запрашиваемые документы в течение десяти рабочих дней с момента получения запроса. Представляются копии документов, заверенные печатью организации и подписью ее руководителя или иного уполномоченного лица; индивидуальный предприниматель заверяет указанные копии своей подписью и печатью (при ее наличии). Закон запрещает контрольным органам требовать нотариально удостоверенные копии запрашиваемых документов.

В случае выявления ошибок и противоречий сведений, содержащихся в представленных на проверку документах, Росприроднадзор (его территориальные органы) имеет право затребовать от проверяемого хозяйствующего субъекта объяснения по данному поводу. Такие объяснения должны быть представлены в контрольный орган также в течение десяти рабочих дней в письменной форме за подписью уполномоченного лица. Подконтрольное лицо имеет право приложить к данным объяснениям дополнительные документы, подтверждающие правильность сведений, содержащихся в объяснениях и представленных для контрольной проверки документах. Государственный инспектор, который проводит документарную проверку, обязан рассмотреть представленные юридическим лицом или индивидуальным предпринимателем пояснения и документы, подтверждающие достоверность ранее представленных документов. В случае если после рассмотрения представленных пояснений и документов либо при отсутствии пояснений орган государственного экологического контроля установит признаки нарушения обязательных требований, государственные инспекторы вправе провести выездную проверку.

Предметом выездной проверки являются содержащиеся в документах юридического лица, индивидуального предпринимателя сведения об осуществлении природопользования, а также соответствие их работников, состояние используемых указанными лицами при осуществлении деятельности территорий, зданий, строений, сооружений, помещений, оборудования, транспортных средств, производимые и реализуемые юридическим лицом, индивидуальным предпринимателем товары (выполняемая работа, предоставляемые услуги) и принимаемые ими меры по охране окружающей среды.

Выездная проверка проводится по месту нахождения юридического лица, месту осуществления деятельности индивидуального предпринимателя и (или) по месту фактического осуществления их деятельности.

Срок проведения контрольных проверок не может превышать двадцать рабочих дней. В отношении одного субъекта малого предпринимательства общий срок проведения плановой выездной проверки не может превышать пятьдесят часов для малого предприятия и пятнадцать часов для микропредприятия в год.

Если в ходе осуществления проверки необходимо провести сложные и (или) длительные исследования, испытания, специальные экспертизы и расследования, то на основании мотивированных предложений государственных инспекторов в области охраны окружающей среды срок проведения выездной плановой проверки может быть продлен руководителем Росприроднадзора или его территориального органа, но не более чем на двадцать рабочих дней в отношении малых предприятий, микропредприятий – не более чем на пятнадцать часов.