У истоков создания факультета стояла Людмила Ивановна Хоружий (2005—2013), заложившая мощный фундамент для его успешного развития. После ее назначения проректором по экономической работе и имущественному комплексу в РГАУ-МСХА, деканом стала кандидат экономических наук Ирина Владимировна Харчева (2013—2017).

В процессе обучения студенты Факультета экономики и финансов успешно овладевали основами рыночного ведения хозяйства, учились умению принимать ответственные решения. В учебном процессе широко использовались прикладное программное обеспечение для автоматизации решения учетно-аналитических и статистических задач, электронные учебные и наглядные пособия, компьютерные лабораторные практикумы, деловые игры, КВНы по дисциплинам направления подготовки «Экономика», профилям «Бухгалтерский учет, анализ и аудит», «Налоги и налогообложение», «Финансы и кредит» и другие формы интерактивного обучения.

С начала 1960-х годов было подготовлено свыше 6000 специалистов учетно—финансового профиля, более 150 кандидатов, 8 докторов экономических наук. Многие выпускники факультета стали известными руководителями и специалистами производства, крупными учеными, руководителями банковских структур, аудиторских компаний, страховых организаций и фискальных органов.

Еще в 1996 г. был создан единственный в системе аграрных вузов Учебно-методический центр Минфина России по аттестации аудиторов и УМЦ по подготовке для рыночной экономики и аттестации профессиональных бухгалтеров Института профессиональных бухгалтеров и аудиторов России. За годы работы УМЦ (1996—2013) в нем прошли обучение и аттестацию свыше 7000 бухгалтеров и 1500 аудиторов.

С 2000 г. учеными Учетно-финансового факультета было разработано и утверждено Министерством сельского хозяйства Российской Федерации более 40 отраслевых нормативных документов и методических рекомендаций в области учета, контроля, анализа и налогообложения в сельском хозяйстве.

Особое внимание на факультете уделялось научно-исследовательской работе. Научно-исследовательская школа «Развитие теории, методологии, методики и организации функционирования бухгалтерского учета и отчетности в аграрной сфере в условиях интеграции с МСФО», основа которой была заложена еще в 1920 г. профессором А. М. Галаганом, объединила к 2014 г. более 15 докторов и кандидатов наук, из которых 50% – молодые ученые до 35 лет. В рамках научно-педагогической школы «Статистика аграрного сектора», основанной в 1885 г. профессором А. Ф. Фортунатовым, в 2014 г. состояло более 12 докторов и кандидатов наук, в том числе член-корреспондент РАН.

Развитию научных школ бухгалтерского учета, аудита, анализа, экономической безопасности способствовало открытие в 2007 г. диссертационного совета по специальности 08.00.12 «Бухгалтерский учет, статистика» под председательством Л. И. Хоружий. За годы работы совета в нем защитили диссертации свыше 40 кандидатов экономических наук.

Совместно с Издательским домом «Панорама» факультет начал в 2007 г. издание ежемесячного научно-практического журнала «Бухучет в сельском хозяйстве». Журнал был включен Высшей аттестационной комиссией Минобразования и науки РФ в Перечень ведущих рецензируемых журналов и изданий, в которых публикуются основные научные результаты диссертаций на соискание степеней доктора и кандидата наук.

В 2006 г. факультет начал сотрудничать с ОАО «Россельхозбанк». Председателем правления и другими специалистами банка читались проблемные лекции студентам и аспирантам факультета. Была разработана программа и организовано прохождение производственной практики в отделениях РСХБ. Впервые ОАО «Россельхозбанк» открыл стипендиальную программу для студентов Учетно-финансового факультета, которая впоследствии была распространена на другие вузы страны. Это успешное сотрудничество продолжается и по сей день.